The use of the nested real-time polymerase chain reaction in the diagnosis of Toxoplasma gondii infections

Toxoplasma gondii infeksiyonu tanısında iki turlu gerçek zamanlı (real-time) polimeraz zincir reaksiyonu yönteminin kullanılması

Aydan BİRİ, Ayşe EREN, Ayşe KALKANCI, Semra KUŞTİMUR, Doğruman Funda AL, Sibel AYDOĞAN

Abstract

This study was performed in order to investigate the presence of Toxoplasma gondii (T. gondii) DNA, in various clinical specimens, obtained from different clinics, using the real-time polymerase chain reaction. Investigation of a total of 80 specimens was carried out using B1 gene region specific primers and probes after the extraction of T. gondii DNA. T. gondii DNA was found in three out of 80 specimens. Out of the three specimens found to be positive for T. gondii DNA, two were amniotic fluid specimens obtained from the Obstetrics and Gynecology Department and one, a cerebrospinal fluid specimen obtained from the Neonatology Department. T. gondii DNA was not found in the blood of a CSF-positive case. DNA was not found in the specimens of the remaining 77 patients.

Özet

Bu çalışma çeşitli kliniklerden laboratuvarımıza gönderilen değişik örneklerdeki Toxoplasma gondii (T. gondii) DNA'sının gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu(PZR) yöntemiyle araştırılması amacıyla yapılmıştır. Toplam 80 örnekten, T. gondii DNA'sı elde edildikten sonra, DNA çoğaltılması T. gondii için düzenlenen B1 gen bölgesine spesifik primer ve problar kullanılarak yapılmıştır. Çalışmaya alınan 80 örnekten üç örnekte T. gondii DNA'sı pozitif bulunmuştur. Bunlardan ikisi kadın doğum kliniğinden gönderilen amnion sıvısı örneği ile biri yeni doğan kliniğinden gönderilen beyin omurilik sıvısı (BOS) örneği olup, BOS örneği pozitif olan bu hastanın kan örneğinde T. gondii DNA'sı saptanmamıştır. Diğer 77 hasta örneğinde de T. gondii DNA'sı tespit edilememiştir.