The Molecular Classification of Blackfly (Diptera: Simuliidae) Species Which Pose a Problem in Nevşehir Part of Central Kızılırmak Basin

Orta Kızılırmak Havzasının Nevşehir Bölümünde Sorun Oluşturan Karasinek (Diptera: Simuliidae) Türlerinin Moleküler Klasifikasyonu

Abstract

Objective: This study was carried out to determine the molecular characterization of simuliid species which cause a problem in the part of Kızılırmak passes from Ürgüp and Gülşehir districts of Nevşehir. Methods: Between May and September 2011, totally 150 simuliid larvae were sampled. Morphological identifications of the collected larvae specimens were done before the molecular analyses. Genomic DNA extractions were utilized on 7 larvae specimens which were selected from morphologically identified samples and the sequence and phylogenetic analyses were performed after the amplification of the partial mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 (mt-COI) and ribosomal complete internal transcript spacer 2 and partial 28S (ITS-2/28S) gene regions.Results: Eighty-five, 46 and 19 out of 150 morphologically examined specimens were identified as Simulium (S.) Wilhelmia sp., S. Wilhelmia lineatum and S. Wilhelmia balcanicum, respectively. Among the amplified samples with respect to mt-COI and ITS-2/28S gene regions, sequence analyses were performed on 3 and 2 isolates from S. Wilhelmia sp. and both S. lineatum and S. balcanicum. The isolates were found to be clustered together depending on the species for both gene regions phylogenetically and the sequence heterogeneity was found to be higher in S. lineatum. When comparing with the other species under the Wilhelmia subgenus, S. lineatum and S. balcanicumwere determined to be more close to each other. Conclusion: Scientific data on the molecular characterization and phylogeny of blackfly species under the S. Wilhelima subgenus which pose a problem in the Central Kızılırmak Basin were provided with this study.

Özet

Amaç: Bu çalışma, Kızılırmak Nehri'nin Nevşehir'in Ürgüp ve Gülşehir ilçelerinden geçen bölümünde, sorun oluşturan simuliid türlerinin moleküler karakterizasyonunun yapılması amacıyla planlanmıştır.Yöntemler: Mayıs-Eylül 2011 tarihleri arasında 150 adet simuliid larva örneklemesi yapılmıştır. Toplanan larvaların önce morfolojik identifikasyonları yapılmış daha sonra moleküler analizleri gerçekleştirilmiştir. Morfolojik teşhisleri yapılan örneklerden seçilen toplam 7 larva örneğinden genomik DNA ekstraksiyonunu yapılmış ve elde edilen DNA'ların parsiyel mitokondriyal cytochrome oxidase subunit 1 (mt-COI) ve ribozomal complete internal transcript spacer 2 ve parsiyel 28S (ITS-2/28S) gen bölgeleri amplifiye edilerek sekans ve filogenetik analizleri yapılmıştır.Bulgular: Morfolojik incelemesi yapılan 150 simuliid larva örneğinin 85'i Simulium (S.) Wilhelmia sp., 46'sı S. Wilhelmia lineatum, 19'u ise S. Wilhelmia balcanicum olarak identifiye edilmiştir. Mt-COI ve ITS-2/28S gen bölgeleri yönünden amplifikasyonları yapılan örneklerden S. Wilhelmia sp. için 3, S. lineatum ve S. balcanicum için de ikişer izolatın sekans analizleri yapılmıştır. Filogenetik olarak izolatların her iki gen bölgesi için de tür bazlı olarak küme oluşturduğu görülmüş, sekans heterojenitesi S. lineatum'da daha yüksek belirlenmiştir. Wilhelmia alt soyundaki diğer türlerle kıyaslandığında S. lineatum ve S. balcanicum'un birbirine daha yakın olduğu saptanmıştır.Sonuç: Bu çalışma ile Orta Kızılırmak Havzasında sorun oluşturan S. Wilhelmia alt soyundaki karasinek türlerinin moleküler karakterizasyonu ve filogenileri üzerine bilimsel veriler sağlanmıştır