İran Kökenli Echinococcus granulosus G1 Haplotiplerinin Sitokrom C Oksidaz (Alt Ünite 1) Dizilimine Dayalı Moleküler Çalışması

Molecular Study of the G1 Haplotypes of Echinococcus granulosus from Iran Based on Cytochrome C Oxidase (Subunit 1) Sequence

Abstract

Objective: In this study, we attempted to identify new Echinococcus granulosus isolates in the North West provinces of Iran based on the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) sequence. Methods: Twenty-nine hydatid cysts from sheep and goats were collected. Genomic DNAs were extracted, and a partial sequence of the CO1 gene was amplified. Polymerase chain reaction products were cloned and sequenced with M13 primers in both directions. Results: All Iranian isolates were located in G1 and G3 genotypes. For the first time, a new G1 haplotype in two Iranian isolates were identified. Conclusion: It seems that this new haplotype was transmitted from Jordan to Iran or vice versa

Özet

Amaç: Bu çalışmada İran'ın kuzey batı bölgelerinde bulunan yeni bir Echinococcus granulosus izolatını mitokondriyal sitokrom c oksidazı alt ünitesi 1 (CO1) dizilimine dayanarak tanımlamaya çalıştık. Yöntemler: Koyun ve keçilerden 29 hidatik kist alındı. Genomik DNA'lar çıkarıldı ve kısmi CO1 dizilimi amplifiye edildi. PCR ürünleri klonlandı ve her iki yönde M13 primerleri ile dizildiler.Bulgular: Tüm İran izolatları G1 ve G3 genotiplerinde yerleşimliydi. İki İran izolatında yeni bir G1 haplotip ilk defa tanımlandı.Sonuç: Bu yeni haplotipin Ürdün'den İran'a ya da tam tersi yönde aktarıldığı düşünülmektedir