Investigation of Blastocystis Subspecies in Water Samples Collected from Ordu Province

Ordu İlinden Alınan Su Örneklerinde Blastocystis Alt Türlerinin Araştırılması

Abstract

Objective: The aim of the study was to determine the prevalence of Blastocystis subspecies in water samples collected from Ordu province. Methods: Seventy-five surface water samples and 25 drinking water samples were collected from Ordu and its boroughs. The samples were flocculated by aluminum sulphate and concentrated by sucrose gradient method. Small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR). Sequence analysis was performed on the positive PCR products and the base sequences were aligned using Bioedit. Phylogeny trees were drawn and Blastocystis subspecies were identified. Results: Four out of the 100 water samples were positive for Blastocystis spp. No positivity was found in the drinking water. Blastocystis ST-1 subspecies was detected in Bülbül River, Kacalı River and Bolaman Stream. Blastocystis ST-3 subspecies were found in Karabalçık River. The lowest genetic distance was found between ST-1 subspecies and the samples from Bülbül River, Kacalı River and Bolaman Stream. The nucleotide similarities between them were 98.8%, 76.6 and 98.8%, respectively. The lowest genetic distance was found between Karabalçık River and ST-3 subspecies and the nucleotide similarity between them was 99.1%. Conclusion: This is the first study on the presence of Blastocystis spp. in the surface water and drinking water samples in Ordu province of the Black Sea area in Turkey.

Özet

Amaç: Ordu ilinden alınan su örneklerinde Blastocystis alt türlerinin yaygınlığını tespit etmek çalışmanın amacını oluşturmuştur.Yöntemler: Ordu il merkezi ve ilçelerindeki çevre sularından 75, içme sularından 25 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekleralüminyum sülfat kullanılarak çöktürülmüş ve sukroz gradiyent yöntemiyle konsantre edilmiştir. Bu örneklerden ribozomal RNAküçük alt birim (SSU rRNA) gen bölgesi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile çoğaltılmıştır. Pozitif PZR ürünlerine sekans analiziyapılmış ve Bioedit kullanılarak baz dizileri hizalanmıştır. Bunu takiben filogeni ağacı çizilerek Blastocystis alt türlerinin tespitiyapılmıştır.Bulgular: Toplam 100 örneğin dördünde Blastocystis spp. PZR ile bulunmuştur. İçme sularında herhangi bir pozitiflik tespitedilmemiştir. Blastocystis ST-1 alt türü, Bülbül Deresi, Kacalı Deresi ve Bolaman Çayı’nda tespit edilmistir. Blastocystis ST-3 alttürü ise Karabalçık Deresi’nde bulunmuştur. Bülbül Deresi, Bolaman Çayı ve Kacalı Deresi örnekleri ile ST-1 alt türü arasında endüşük genetik uzaklık değerleri bulunmuştur. Bu örnekler ile ST-1 alt türü arasında sırasıyla %98,8, %76,6 ve %98,8 nükleotitbenzerliği saptanmıştır. Karabalçık Deresi ile ST-3 arasındaki en düşük genetik uzaklık değeri bulunarak, %99,1 oranında nükleotitbenzerliğine rastlanmıştır.Sonuç: Bu çalışma, Karadeniz bölgesindeki Ordu ilinden alınan çevre suları ve içme suyu örneklerinde Blastocystis spp.’ninaraştırıldığı ilk çalışmadır.