First Molecular Characterisation of Blastocystis from Experimental Rats in Turkey and Comparison of the Frequencies Between Obese and Non-obese Groups

Türkiye’de İlk Kez Kemirgenlerde (Laboratuvar Ratlarında) Blastocystis’in Moleküler Karakterizasyonu ve Obez/Non-obez Ratlarda Yaygınlığının Karşılaştırılması

Hatice ERTABAKLAR, Sema ERTUĞ, Erdoğan MALATYALI, Alpaslan GÖKÇİMEN, Gizem BAŞARAN

Abstract

Objective: Blastocystis is a zoonotic protozoan that infects a wide range of animals, including humans and rodents. This study aimed to determine the frequency and subtype distribution of Blastocystis in laboratory rats at a laboratory animal facility in Turkey. Methods: This study included 54 male Sprague-Dawley rats from Aydın Adnan Menderes University Laboratory Animal Center. Among these rats, 30 were fed with high-fat diet (obese group) and the remaining 24 received standard chow (non-obese group). Blastocystis positivity was determined with amplification of small subunit 18S rRNA gene following their nucleic acid extraction from faecal samples. Subtypes were detected by submitting the partial 18S rRNA gene sequences to the database (pubmlst. org/blastocystis). The phylogenetic tree from evolutionary distance data was constructed using the neighbour-joining method. Results: Blastocystis infection was detected in 33 (61.1%) of 54 laboratory rats. The frequency of Blastocystis was significantly different between obese and non-obese rats (p

Özet

Amaç: Blastocystis, insanlar ve kemirgenler dahil birçok canlıda görülen zoonotik karakterli bir protozoondur. Bu çalışmada, Türkiye’de ilk kez kemirgenlerde (laboratuvar ratlarında) Blastocystis görülme sıklığının ve alt tiplerinin belirlenmesi, ayrıca obezite ile ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışmaya Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Deney Hayvanları Merkezi’nde yer alan 54 erkek Sprague-Dawley rat dahil edilmiştir. Bunların 30’unu yüksek yağlı diyetle (obez) beslenmiş ratlar, kalan 24’ünü standart (normal) yem ile beslenen ratlar oluşturmuştur. Blastocystis pozitifliği, dışkı örneklerinden nükleik asit ekstraksiyonu sonrası küçük alt birim 18S rRNA geninin amplifikasyonu ile belirlenmiştir. Blastocystis alt tipleri, kısmi 18S rRNA gen sekanslarının veri tabanında (pubmlst.org/ blastocystis) karşılaştırılması ile tespit edilmiştir. Ayrıca, neighbor-joining metodu kullanılarak izolatların evrimsel uzaklıklıklarını gösteren filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Bulgular: Çalışmamızda 54 laboratuvar ratının 33’ünde (%61,1) Blastocystis tespit edilmiştir. Ek olarak, Blastocystis görülme sıklığı obez ve normal ratlar arasında istatistiksel olarak anlamlı düzeyde farklılık göstermiştir (p