Journals / Türk Biyokimya Dergisi / 2015 / Cilt: 40 - Sayı: 5
Üç İran popülasyonunda CAT C-262T genetik polimorfizminin dağılımı
- Journal
- Türk Biyokimya Dergisi
- Pages
- 386–389
- DOI
- —
Abstract
Objective: Catalase (CAT) activity is likely to be affected by functional polymorphism of C-262T (rs1001179) in the CAT gene (OMIM: 115500). It is hypothesized that individuals with the lower expressing forms of the CAT polymorphism may be more susceptible to breast cancer. In order to find the allelic frequency of the C-262T polymorphism among Iranian populations, the present study was carried out.Methods: The total study subjects consisted of 1057, 200, and 200 individuals from Shiraz (Fars province; belong to Persians), Abarku (Yazd province; belong to Persians), and Yasuj (Kohgiluyeh va Boyer-Ahmad province; belong to Lurs), respectively. Genotypic analysis for the CAT C-262T polymorphism was determined by PCR.Results: The frequency of the T allele was 0.2044±0.0138, 0.1825±0.0193, and 0.1800±0.0192 in Shiraz, Abarku, and Yasuj, respectively. The genotypic frequencies of the control subjects did not show significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium. Statistical analysis indicated that there was no significant difference between these populations for the genotypic distributions of the CAT C-262T polymorphism (?2=2.73, df=4, P=0.603).Conclusion: The frequency of the T allele among Iranian populations was very similar to that reported for Caucasians and was higher than Asians and African-American populations.
Özet
Amaç: Katalaz aktivitesinin, CAT geni (OMIM: 115500) üzerindeki C-262T (rs1001179) polimorfizminden etkilendiği düşünülmektedir. CAT geninin değişik polimorfik türlerinin düşük ekspresyonu olan bireylerde meme kanserine yatkınlığın arttığı varsayılmaktadır. Bu çalışma İran popülasyonlarında C-262T alel frekanslarını saptamak için yürütülmüştür.Metod: Bu çalışmada Şiraz (Fars eyaleti, Pers kökenli) bölgesinden 1057, Abarku (Yezidi eyaleti, Pers kökenli) bölgesinden 200, Yasui (Kohgiluyeh va Boyer-Ahmad eyaleti, Lur kökenli) bölgesinden 200 kişi çalışılmıştır. CAT C-262T polimorfizminin genotipik analizleri PCR tekniği kullanılarak saptanmıştır.Bulgular: Şiraz, Abarku ve Yasui bölgeleri için T aleli frekansı sırasıyla 0.2044±0.0138, 0.1825±0.0193, ve 0.1800±0.0192 olarak bulunmuştur. Kontrol bireylerin genotip frekansları ise Hardy-Weinberg dengesinden sapma göstermemiştir. Ek olarak, CAT C-262T polimorfizmi genotipik dağılımı bu popülasyonlar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark göstermemiştir (?2=2.73, df=4, P=0.603).Sonuç: Iran popülasyonlarında saptanan T aleli frekansı beyaz ırk popülasyonları için raporlanan sonuçlara yakın ancak Asya ve Afrika - Amerikan popülasyonlarından yüksek bulunmuştur.