Role of SNPs of CPTIA and CROT genes in the carnitine-shuttle in coronary artery disease: a case-control study

Koroner arter hastalığında karnitin mekiği CPTIA ve CROT genlerinde genetik varyasyonlarının rolü: Vaka – kontrol çalışması

Özlem KURNAZ GÖMLEKSİZ, Zehra BUĞRA, Hülya YILMAZ AYDOĞAN, Aslıhan DEMİRCAN, Fatih YANAR, Ender ÇOŞKUNPINAR, Deniz KANCA, Gülçin ÖZKARA, Oğuz ÖZTÜRK

Abstract

Objective: Fatty acid β-oxidation defects can lead to difficulties at covering energy requirement of heart. Thecarnitine-shuttle is responsible for the transfering oflong-chain fatty acids from the internal mitochondrialmembrane. The role of genetic variants of the enzymes inthe carnitine shuttle in coronary artery disease (CAD) hasnot been studied. Therefore, we performed a case-controlstudy investigating the possible relation between theCPTIA-rs3019613 and CROT-rs2214930 gene variationslocated carnitine shuttle and CAD risk.Materials and methods: Study groups were comprisedof 96 CAD patients and 85 controls. CPTIA-rs3019613G > A and CROT-rs2214930 T > C polymorphisms weredetermined by real-time-PCR.Results: The CROT-rs2214930-CC genotype was found tobe associated with decreased HDL-cholesterol (HDL-C) incontrols (p = 0.029). In patients with CPTIA-rs3019613-Aallele, body mass index (BMI) (p = 0.016) and BMI threshold-value (p = 0.030) were found be higher compared tothose with GG-genotype, while HDL-C threshold-value(HDL-C ≤ 0.90 mmol/L) was found to be lower (p = 0.015).Regression analysis confirmed CPTIA-rs3019613-A allelehas a significant relationship with decreased HDL-C(p = 0.009) in patients.Conclusion: Our study indicated that the polymorphismsof the CROT and CPTIA genes related to β-oxidation oflong-chain fatty acids had an important effect on serumHDL-C levels and may be a potential risk for CAD.

Özet

maç: Yağ asit β oksidasyonundaki defektler kardiyovasküler problemlere ve kalbin ihtiyacı olan enerjinin karşılanmasında güçlüklere yol açabilir. Karnitin mekiği, uzun zincirli yağ asitlerinin iç mitokondriyal zardan transferinden sorumludur. Koroner arter hastalığında (KAH) karnitin mekiğindeki enzimlerin genetik varyantlarının rolü henüz çalışılmamıştır. Bu nedenle karnitin mekiğinde yer alan CPTIA rs3019613 G > A ve CROT rs2214930 T > C gen varyasyonları ile KAH riski arasındaki olası ilişkiyi araştıran bir vaka kontrol çalışması yaptık. Gereç ve yöntem: Çalışma grupları 96 KAH hastası ve 85 kontrolden oluşturulmuştur. CPTIA rs3019613-G > A ve CROT rs2214930 T > C polimorfizmleri gerçek zamanlı PZR ile tespit edilmiştir. Bulgular: Kontrol grubunda CROT rs2214930 CC genotipi düşük HDL-Kolesterol (HDL-K) düzeyleri ile ilişkili bulunmuştur (p = 0.029). CPTIA rs3019613 A aleli olan hastalarda GG genotipli olanlara göre, vücut kitle indeksi (VKİ) (p = 0.016) ve VKİ eşik değeri (p = 0.030) daha yüksek iken, HDL-K eşik değeri (HDL-C ≤ 0.90 mmol/1) daha düşük bulundu (p = 0.015). Regresyon analizi, CPTIA rs3019613 A alelinin, hastalarda azalmış HDL-K (p = 0.009) ile ilişkisini doğrulamıştır. Sonuç: Çalışmamız uzun-zincirli yağ asitlerinin β oksidasyonu ile ilişkili olan CROT ve CPTIA gen polimorfizmlerinin serum HDL-K düzeylerine önemli etkisi olduğunu ve KAH için potansiyel risk olabileceğine işaret etmektedir.