MHC Class I related chain A (MICA), Human Leukocyte Antigen (HLA)-DRB1, HLA-DQB1 genotypes in Turkish patients with ulcerative colitis

Fatma SAVRAN OĞUZ, Filiz AKYÜZ, Kadir DEMİR, Binnur PINARBAŞI, Sonay TEMURHAN, Çiğdem KEKİK ÇINAR

Abstract

Objectives: We aimed to determine Human LeukocyteAntigen (HLA)-DRB1, DQB1, and MHC Class I related chainA (MICA) genotypes in patients with ulcerative colitis.Methods: HLA-DRB1, HLA-DQB1, MICA genotyping ofpatient (n:85) and controls (n:100) were performed by PCRSSO Luminex (One Lambda genotyping kit).Results: We found significantly higher DRB1*01 (p:0.022,OR:0.23, CI:0.06–0.8) and MICA*0002/20/55 (p:0.03,OR:0.53, CI:0.29–0.93) alleles in control group whereasDRB1*14 (p:0.04, OR:2.25, CI:1–5.08), DRB1*15 (p:

Özet

Amaç: Ülseratif kolit, kronik enflamatuvar bir bağırsak hastalığıdır. HLA alelleri, enflamatuvar bağırsak hasta lıklarının patogenezinde önemli bir rol oynar. HLA DRB1*09, DRB1*1502, DRB1*0103 ve DRB1*13 alellerinin ülseratif kolit ile ilişkili olduğu bildirilirken HLA DRB1*04 ve DRB1*08 alellerinin koruyucu olduğu bil dirilmiştir. Bakteriyel antijenler kolon lümeninde MICA ekspresyonunu indükler ve MICA geni ülseratif kolit gelişimi için önemlidir. MICA*06 ve MICA*007 alelleri Ülseratif kolit ile ilişkilendirilmiştir. Ülseratif kolitli hastalarda HLA-DRB1, DQB1, MICA genotiplerini belir lemeyi amaçladık. Gereç ve yöntemler: Hasta (n: 85) ve kontrol grubunun (n: 100) HLA-DRB1, HLA-DQB1, MICA genotiplemesi PCR-SSO Lumineks (One Lambda genotipleme kiti) yöntemiyle gerçekleştirildi. Bulgular: DRB1*01 (p: 0.022, OR: 0.23, CI: 0.06–0.8) ve MICA*0002/20/55 (p: 0.03, OR: 0.53, CI: 0.29-0.93) allelleri kontrol grubunda anlamlı olarak daha yüksek iken, DRB1*14 (p: 0.04, OR: 2.25, CI: 1–5.08), DRB1*15 (p: