Amino acid metabolism disorders and PAH gene mutations in Southeastern Anatolia Region

Güneydoğu Anadolu Bölgesinde Aminoasid Metabolizma Bozuklukları ve PAH Gen Mutasyonları

Ataman GÖNEL, Emiş Deniz AKBULUT, Müjgan ERCAN KARADAĞ, İsmail KOYUNCU, Özlem ÖZ

Abstract

Objectives: Inborn errors of metabolism are generally autosomal recessive inherited disorders. The incidence and genetic features of neonatal metabolic disorders vary significantly by regions and populations. In this study, we aimed to determine the amino acid metabolism disorders and evaluate the genetic test results of these patients retrospectively. Methods: The blood samples collected from heel blood and dried on filter cards in the neonatal screening program, were analyzed for amino acid metabolism disorders by (LC)-MS/MS method. Patients with suspected metabolic diseases were diagnosed with NGS method. Results: Amino acid metabolism disorders were detected in 66 of 2,104 patients who were screened for suspected neonatal metabolic disorders. Sixty-two of 66 patients were diagnosed with phenylketonuria, the rest of them were diagnosed with tyrosinemia type I, arginosuccinate lyase deficiency, citrullinemia type 1 and Maple Tree syrup dis ease. The most common PAH gene mutations were c.1208C>T (A403V). Conclusion: Phenylketonuria was the most common dis ease among amino acid metabolism disorders in Şanlıurfa. There were different allele frequencies compared to the PAH mutations reported in previous studies. This may be due to the different characteristics of the populations and also the high rate of consanguineous marriage in our region.

Özet

Amaç: Doğumsal metabolizma bozuklukları genellikle otozomal resesif geçiş gösteren hastalıklardır. Yenidoğan metabolik bozukluklarının insidansı ve genetik özellikleri bölgelere ve popülasyonlara göre önemli ölçüde değiş kenlik gösterir. Bu çalışmada Şanlıurfa’da görülen amino asit metabolizması bozukluklarının belirlenmesi ve bu hastaların genetik test sonuçlarının retrospektif olarak incelenmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntemler: Yenidoğan tarama programında, topuk kanından toplanmış ve filtre kartlarında kurutulmuş kan örnekleri amino asit metabolizması bozuklukları açısından LC-MS/MS yöntemiyle analiz edildi. Metabolik hastalık şüphesi olan hastalara NGS yöntemi ile tanı konuldu. Bulgular: Doğumsal metabolizma bozukluğu ön tanısı ile taranan toplam 2,104 hastanın 66’sında aminoasit meta bolizma bozukluğu bulundu. 66 hastanın 62’sinde fenil ketonüri tanısı, geri kalanında ise Tirozinemi tip I, Arjininosukinat liyaz eksikliği, Sitrullinemi tip 1 ve Akça Ağaç şurubu hastalığı tanısı konuldu. En sık gözlenen PAH gen mutasyon c.1208C>T (A403V) idi. Sonuç: Şanlıurfa’da amino asit metabolizma bozuklukları arasında en sık görülen hastalık fenilketonüri olarak göz lendi. Sonuçlarımıza göre, önceki çalışmalarda bildirilen PAH mutasyonlarına göre farklı alel frekansları mevcuttu. Bu durum, popülasyonumuzun farklı özelliklere sahip olması ve bölgemizdeki akraba evliliği oranının yüksek olmasından kaynaklanabilir.