Effects of SNP within Exon 7 of the Insulin-like Growth Factor Receptor Type 1 (IGF1R) Gene on Growth Traits in Angus Cows

İnsülin-benzeri Büyüme Faktörü Reseptör Tip 1 (IGF1R) Geninin Ekson 7 İçindeki Tek Nükleotid Polimorfizminin (SNP) Angus İneklerinin Büyüme Ölçütleri Üzerine Olan Etkileri

Özet

İnsülin benzeri büyüme faktörü-1 reseptör (IGF1R) sinyal yolu, doğum sonrası büyüme ve gelişmede önemli bir rol oynar. IGF1R tirozin kinaz reseptörü, IGF1R'nin otofosforilasyonunu tetikleyen IGF-I tarafından aktive edilen homodimerleri ve sonrasında meydana gelen aşağı sinyal transdüksiyonu oluşturmaktadır. Bu çalışmanın amacı, sığır IGF1R geni içinde bulunan ekzon 7 içindeki sessiz SNP (rs41961336; CàT) ile büyüme özellikleri arasındaki ilişkinin tanımlanması, karakterize edilmesi ve incelenmesidir. Dört farklı ırktan toplam 672 adet inek polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon parça uzunluk polimorfizmi (PCR-RFLP) metodu kullanılarak genotiplenmiştir. Çalışılan tüm ırklar (Polonya Holstein Friesian, Angus, Hereford, Limousine) içinde, her üç genotip varlığı sadece Angus ırkında gözlenmiştir. CC genotipi araştırılan tüm ırklarda en sık gözlenen genotip olmuş (0.7987-0.9904) ve bunu CT genotipi takip etmiştir (0.00960.1946). Sadece Angus inekleri ilişkilendirme analizleri için seçilmiştir. 210 günlük yaşa (WWT210) düzeltilmiş sütten kesim ağırlığında, CC genotipli dişi buzağıların, CT genotipli bireylerden istatistiki olarak daha ağır oldukları (+5.5 kg) bulunmuştur (P

Abstract

Insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R) signaling pathway plays a key role in the postnatal growth and development. The tyrosine kinase receptor IGF1R forms homodimers that is activated by IGF-I which trigger autophosphorylation of IGF1R and subsequent downstream signal transduction. The objectives of this study were to identify, characterize and the examination of the association between silent SNP (rs41961336; CàT) within exon 7 of bovine IGF1R gene and growth traits. A total of 672 cows of four breeds was genotyped using the Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method. A TaiI restriction endonuclease was used. Among all breeds under study (Polish Holstein Friesian, Angus, Hereford, Limousine), the presence of all three genotypes was observed only for the Angus breed. The CC genotype was the most frequent in all investigated breeds (0.7987-0.9904) followed by CT (0.0096-0.1946). Only Angus cows were selected for association analysis. At weaning weight adjusted to 210 days of age (WWT210), statistically significant differences (P