EVALUATION OF CONVENTIONAL CYTOGENETIC,MOLECULAR CYTOGENETICS AND MOLECULARGENETICS RESULTS IN HEMATOLOGICALMALIGNANCES

HEMATOLOJİK MALİGNİTELERDE KONVANSİYONEL SİTOGENETİK, MOLEKÜLER SİTOGENETİK VE MOLEKÜLER GENETİK SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

Barbaros YİĞİT, Pınar ASLAN KOŞAR, Emine Güçhan ALANOĞLU, Muhammet Yusuf TEPEBAŞI

Abstract

Objective Hematological malignancies are neoplasms of bonemarrow-derived cells. Epidemiological and clinicalstudies show that the mutations occurring in soma tic cells include numerical and structural chromoso mal abnormalities and specific gene-level changes inmost of these malignancies. It has been determinedthat these changes have a critical role in the diagno sis and follow-up of hematological malignancies, aswell as in the choice of treatment and determining theprognosis. Our study aims to determine what thesegenetic changes occur as chromosomal and molecu lar in patient groups with hematologic malignancy. Materials and Methods In this study, 110 patients who were admitted to theDepartment of Hematology of the Süleyman DemirelUniversity Faculty of Medicine with a pre-diagnosis ordiagnosis of Hematologic Malignancy were included.Three different analyses applied to the cultured bonemarrow tissue samples of seven groups of hemato logy patients who suffered from Acute Myeloid Leuke mia (AML), Chronic Myeloid Leukemia (CML), Chro nic Lymphoblastic Leukemia (CLL), MyelodysplasticSyndrome (MDS), Chronic Myeloproliferative Ne oplasm (CMPN), Malignant Plasma Cell Neoplasm(MPCN) and Lymphoma diseases. Numerical andstructural chromosomal changes were examined bycytogenetic chromosome analysis and Fluorescent InSitu Hybridization (FISH) methods and JAK-2 V617Fmutation was analyzed by Real-Time PCR (RT-PCR). Results As a result of cytogenetic and FISH analyzes, thet(9;22) mutation was found to be 30.8% and 22.6%positive for CML, and t(15;17) was found to be positiveat 7.7% for AML. Also, del(5q) and del(7q) were eva luated for MDS and no deletion was detected. Whenthe patients were evaluated in terms of del (13q14)and del (17p13), varying rates were found in lymp homa (28.6% and 71.4%) CLL (50% and 62.5%) andMPHN (50% and 85.7%) patients. Also, according tothe results of RT-PCR, the JAK-2 V617F mutationwas found as heterozygous positive in the CML pa tient group (18.8%) and CMPN patient group (81.2%).Conclusion In the light of the findings we have obtained in our la boratory, we think that examining patients with hema tological malignancies in addition to the existing ge netic analyzes that are routinely studied and studyingthe patient groups by expanding them will contributeto the evaluation of the diagnosis and prognosis ofthe disease.

Özet

Amaç Hematolojik maligniteler, kemik iliği kaynaklı hücrele rin neoplazmlarıdır. Epidemiyolojik ve klinik çalışma lar sonucunda somatik hücrelerde meydana gelenmutasyonların, bu malignitelerin çoğunda sayısal veyapısal kromozomal anomaliler ile spesifik gen düze yindeki değişiklikler içerdiğini göstermektedir. Oluşanbu değişikliklerin hematolojik malignensilerin tanı vetakibinde aynı zamanda tedavi seçimi ve progno zu belirlemede kritik role sahip olduğu belirlenmiştir.Çalışmamız, hematolojik maligniteye sahip hasta gu ruplarında kromozomal ve moleküler olarak meydanagelen bu genetik değişikliklerin neler olduğunu tespitetmeyi amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntem Bu çalışmaya Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fa kültesi Hematoloji Anabilim Dalı'na hematolojik malig nite ön tanısı veya tanısı ile başvuran 110 hasta dahiledildi. Akut Miyeloid Lösemi (AML), Kronik MiyeloidLösemi (KML), Kronik Lenfoblastik Lösemi (KLL), Mi yelodisplastik Sendrom (MDS), Kronik Miyeloprolife ratif Neoplazm ( KMPN), Multipl Myelom (MM)/DiğerPlazma Hücreli Neoplazmlar (DPHN) ve Lenfomahastalıklarına sahip yedi grubun kemik iliği kültürleriyapılarak üç farklı analiz yöntemi ile incelendi. Sayı sal ve yapısal kromozomal değişiklikler sitogenetikkromozom analizi ve Floresan In Situ Hibridizasyon(FISH) yöntemleri ile ve JAK-2 V617F mutasyonu Re al-Time PCR (RT-PCR) ile analiz edildi. Bulgular Sitogenetik ve FISH analizileri sonucunda, KML içint(9;22) mutasyonu %30,8 ve %22,6 oranlarında, AMLiçin t(15;17) %7,7 oranında pozitif bulundu. Ayrıca,MDS için del (5q) ve del (7q) değerlendirildi ve deles yon saptanmadı. Hastalar del(13q14) ve del(17p13)açısından değerlendirildiğinde, lenfoma (%28,6 ve%71,4) KLL (%50 ve %62,5) ve MPHN (%50 ve%85,7) hastalarında değişen oranlarda bulundu. Ay rıca RT-PCR sonuçlarına göre JAK-2 V617F mutas yonu, KML hasta gurubunda (18.8%) KMPN hastagrubunda ise (81.2%) heterozigot positive olarak bu lunmuştur. Sonuç Laboratuvarımızda elde ettiğimiz bulgular ışığında,hematolojik maligniteye sahip hastaların rutinde ça lışılan mevcut genetik analizlerine ek olarak belirle diğimiz mutasyonlarında incelenmesi ve hasta grup larının da genişletilerek çalışılmasının hastalığın tanıve prognozunun değerlendirilmesine katkıda buluna cağını düşünmekteyiz.