Design and Analysis Of Recombinant Vaccine Against Clostridium Perfringens Type A and Type E

Clostridium Perfringens Tip A ve Tip E'ye Karşı Rekombinant Aşı Tasarımı ve Analizi

Abstract

Objective: Clostridium perfringens (C. perfringens) is aspore-forming, anaerobic, gram positive, bacteria that foundin environment, soils, foods, and in intestinal traces of humansor animals. However, vaccines being developed for use inanimals have the potential to be developed for use in humans.This study was aimed to design and analysis of multi epitopevaccine against C. perfringens type A and E.Material-Method: The B cell epitopes were predicted byIEDB (https://www.iedb.org/) and MCH Class II epitopeswere predicted by Vaxign 2 Beta (http://www.violinet.org/vaxign/) and Propred-I 2003 (http://crdd.osdd.net/raghava/propred1/) web server.Results: Physicochemical study of vaccine showed that thedesigned vaccine is 58.33 kDa. The half-life of candidatevaccine was found to be greater than 100 hours in mammaliancells, greater than 20 hours in yeast, and greater than 10hours in Escherichia coli. The instability index of vaccinewas 28.41 (

Özet

Amaç: Clostridium perfringens (C. perfringens), çevrede, topraklarda, gıdalarda ve insanların veya hayvanların bağırsaklarında bulunabilen ve spor oluşturan, anaerobik ve gram pozitif bakteridir. Hayvanlarda kullanmak için geliştirilen aşılar insanlar tarafından da kullanma potansiyeline sahip olabilir. Bu çalışmada, C. perfringens tip A ve E'ye karşı çoklu epitop aşısının tasarlanması ve analizi amaçlanmıştır. Materyal-Metot: B hücresi epitopları IEDB (https://www. iedb.org/) ve MCH Class II epitopları ise Vaxign 2 Beta (http://www.violinet.org/vaxign/) ve Propred-I 2003 (http:// crdd.osdd.net/raghava/propred1/) programın kullanarak tasarlanmıştır. Bulgular: Elde edilen fizikokimyasal sonuçlara göre tasarlanan aşı 58,33 kDa ağırlığına sahip olmaktadır. Aday aşının yarılanma ömrü memeli hücrelerinde 100 saatin üzerinde, mayada 20 saatin üzerinde ve Escherichia coli'de 10 saatin üzerinde olduğu bulunmuştur. Aşının instabilite indeksi 28,41 (