Determination of genetic structure in Barbus tauricus Kessler, 1877 populations inhabiting a few streams along the Black Sea Region (Turkey) inferred from mtDNA Cytochrome b gene sequence analysis

Karadeniz Bölgesi (Türkiye) boyunca bazı akarsularda yaşayan Barbus tauricus Kessler, 1877 populasyonlarının mtDNA Sitokrom b sekans analizleri ile genetik yapısının belirlenmesi

Abstract

This study was carried out in order to determine the intra-specific variations in Barbus tauricus populations sampled from differentlocalities in the Black Sea Region. A total of 250 B. tauricus samples were collected from inland waters (Akçay Stream (Samsun), Engiz Stream(Samsun), Terme Stream (Samsun) Karadere Stream (Trabzon) and Değirmenağzı Stream (Düzce)) of Black Sea Region. Intra-species variationsin the species of B. tauricus were determined using mitochondrial DNA cyt b squencing. The population genetic structure was revealed byanalyzing the molecular variance (AMOVA). For this study, a member of the related fish group, Cyprinus carpio L., 1758 (DQ868874.1)(as anoutgroup) and other Barbus species from the GENBANK database was used in comparative analyses. Therefore, total sequence of 1141 bp ofthe cyt b gene region was obtained and 11 haplotypes were determined. The molecular data obtained by AMOVA revealed that there wereintraspecific variations of B. tauricus and that 26.61% of the variation were among the populations. The FST value estimated for all populationsand loci confirms genetic heterogeneity in B. tauricus populations (FST= 0.59310). Genetic analyses revealed that B. tauricus populations aregeographically structured.

Özet

Bu çalışma Karadeniz Bölgesi’ndeki farklı alanlardan örneklenen Barbus tauricus populasyonları arasındaki türiçi varyasyonları ortaya çıkarmak için gerçekleştirilmiştir. Karadeniz Bölgesi’ndeki farklı içsulardan (Akçay (Samsun), Engiz Çayı (Samsun), Terme Çayı (Samsun) Karadere (Trabzon) and Değirmenağzı Deresi (Düzce)) toplamda 250 örnek yakalanmıştır. Tür içi varyasyonlar mtDNA cyt b sekansı kullanılarak saptanmıştır. Popülasyonların genetik yapıları moleküler varyans analizi (AMOVA) ile belirlenmiştir. Bu çalışmada GENBANK veri tabanından alınan Cyprinus carpio L., 1758 (DQ868874.1)(dış grup) ve diğer Barbus türleri karşılaştırmalı analizlerde kullanılmıştır. Cyt b gen bölgesinin 1141 baz çiftlik toplam sekansı ve 11 haplotip elde edilmiştir. AMOVA analizinden elde edilen moleküler veriler B.tauricus türiçi varyasyonun varlığını ve varyasyonun % 26.1 oranında gruplar arasında olduğunu ortaya çıkarmıştır. Tüm populasyonlardan elde edilen FST değeri populasyonlardaki genetik heterojeniteyi doğrulamaktadır (FST= 0.59310). Genetik analizler, B. tauricus populasyonlarının coğrafik olarak farklılıklar gösterdiğini ortaya çıkarmıştır.