Molecular Epidemiology of Hepatitis B Virus

Abstract

In addition to high viral copy number during replication, HBV reverse transciptase also does not have a proofreading function, therefore, many HBV genotypes, subgenotypes, mutants and recombinants can emerge. To date, 10 HBV genotypes (A-J) and almost 40 subgenotypes have been identified. Genotype A is dominant in Northwest Europe, North America and Africa; genotype B and C are common in Asian countries; genotype C is more dominant in East and Southeast Asian countries. Genotype D is widespread in the whole world and is endemic in the Meditteranean area, the Middle East and Western Asia. Genotype E is dominant in Western Africa and genotype H has been found in Central and South America. Genotype G has been reported in France, Germany and America. The genotype H is found in Central America. Recently identified genotype I, a recombination of genotypes A, C and G, was isolated in Vietnam and Laos. The most recent genotype J was identified in the Ryukyu islands in Japan and this genotype has a relationship between gibon/orangutan genotypes and human genotype C. In this review, HBV genotypes and subgenotypes, their geographic distributions and clinical aspects were overviewed. Klimik Dergisi 2016; 29(2): 56-60

Özet

Hepatit B virusu (HBV)'nun replikasyon sırasında oluşturduğu yüksek viral kopya sayısı ve ters transkriptaz enziminin hata düzeltme ("proofreading") aktivitesinden yoksun olmasına bağlı olarak, HBV genotipleri, subgenotipleri, mutantlar ve rekombinantlar meydana gelmektedir. Günümüze kadar HBV'nin A'dan J'ye kadar 10 farklı genotipi ve 40'a yakın subgenotipi tanımlanmıştır. Kuzeybatı Avrupa, Kuzey Amerika ve Afrika'da genotip A; Asya ülkelerinde genotip B ve C yaygın olarak görülürken; genotip C Doğu ve Güneydoğu Asya ülkelerinde daha baskın olarak görülmektedir. Genotip D, tüm dünya genelinde yaygın olmakla birlikte Akdeniz Bölgesi, Yakın Doğu ve Ortadoğu ülkeleriyle Güney Asya'da daha sık görülmektedir. Batı Afrika'da genotip E; Orta ve Güney Amerika'da genotip F daha baskındır. Genotip G ise Fransa, Almanya ve Amerika'dan bildirilmiştir. Genotip H, Orta Amerika'da bulunmaktadır. Yeni tanımlanan genotip I ise genotip A, C ve G'nin genotipik rekombinasyonu olarak ortaya çıkmış olup Vietnam ve Laos'tan izole edilmiştir. En yeni genotip olan genotip J, Japonya'nın Ryukyu adalarında tanımlanmıştır ve bu genotipin gibon/orangutan genotipleri ve insan genotip C'siyle yakın ilişkisi bulunmaktadır. Bu derlemede, HBV'nin günümüze kadar tanımlanmış genotip ve subgenotipleri, coğrafi yayılımı ve klinik tablolarla ilişkisi gözden geçirilmiştir. Klimik Dergisi 2016; 29(2): 56-60