Progesteron reseptöründe mutasyona açık nokta

Abstract

Backgroud: Progesterone is an important female hormone. A disorder at progesterone receptor (PR) is a condition that relate to the many female specific disorders. This steroid hormone receptor plays a critical role in the development of breast cancer. Mutation within PR can be seen. Presently, prediction of protein nanostructure and function is a great challenge in the proteomics and structural genomics era. METHODS: To identify the point vulnerable to mutate is a new trend to expand the knowledge on disorders in genomic and proteomic level of diseases. Here, the author performed a bioinformatics analysis to study the determine positions that tend to comply peptide motifs in the amino acid sequence of PR. To identify the weak linkage in PR, a new bioinformatics tool namely GlobPlot was used. RESULTS: According to this work, the positions resist to mutation are identified. CONCLUSION: Based on this study, the weak linkages in the PR can be identified and can be good information for the prediction of possible new mutations that can result in phenotype abnormality. In addition, the results from this study can be good information for further research on the diagnosis PR abnormalities and new treatment.

Özet

Progesteron önemli bir kadınlık hormonudur. Progesteron reseptöründeki bir bozukluk, pek çok sağlık sorunu ile ilişkili bir durum oluşturmaktadır. Bu steroid hormon reseptörü, meme kanseri gelişiminde kritik rol oynamaktadır. Bazı klinik durumlarda progesteron reseptöründe mutasyon gözlenebilmektedir. Günümüzde protein nanoyapısının tayini ve fonksiyonu proteomik ve yapısal genetik alanının önemli ilgi alanıdır. Mutasyona hassas noktayı tanımlamak, hastalıkların genomik ve proteomik seviyesini belirlemek hastalık konusundaki bilgilerin artmasına yönelik izlenen yeni eğilimdir. Bu yazıda, araştırmacı progesteron reseptöründe aminoasit motiflerinin pozisyonlarını tayin edecek biyoinformatik analize gitmiştir. Bu amaçla, progesteron reseptörlerinde zayıf bağı tayin etmek için ‘GlobPlot’ adında yeni bir biyoinformatik araç kullanılmıştır. Bu çalışmaya göre mutasyona dirençli noktalar belirlenmiş, zayıf bağlar tanımlanabilmiş ve fenotipte farklılık yaratabilecek yeni mutasyonlar hakkında yeni bilgiler edinilmiştir. Ayrıca, bu çalışma, progesteron reseptör anormallikleri ve bunların tedavilerine ışık tutulabilir.