Bilgi buluşuna yönlendirilmiş sinirbilim-bilgi kaynak sistemi: Tasarım ve ilk uygulama

Neuroinformatics literature system oriented to knowledge discovery: Design and preliminary implementation

Abstract

Neuroscience research has brought on enormous amounts of diverse data, this has led to the difficulty for the neuroscientists to grasp all userful information and conduct the comprehensive brain research independently. In addition, many barriers exist to the querying of multiple databases, including mismatches in query language, access mechanisms, data models and semantic deduction. In order to solve the neuroscientific information integration and database interoperability, we have been developing an internet-accessible Neuroinformatics Literature System(NILS) for neuroimaging and brain function research. NILS is designed for knowledge discovery and NILS consists of 8 main function modules: System Maintenance, Literature Renewal, Literature Retrieval, Result Display/Output, Literature Information Analysis, Neuroimaging Integration, Neuroinformation Text Mining and Nerve Ontology Prototype Construction. It makes possible to semiautomatic gather, coordinate, analyze and store data from multiple underlying sources into a single high-performance environment operating from a local server, provides multi-disciplinary and multi-level integrative retrieval service, helps us to establish a network of comprehensive neuroscientific knowledge for fully understanding the brain principle of work. NILS will not only serve as a foundation platform for the future study pattern driven by hypothesis, but also reveal a great variety of implication relations in the literature, which was previously rarely-known.

Özet

Nörolojik bilimler araştırmaları önemli ölçüde bilgi birikimine neden olmuştur, bu nedenle sinir bilimci bütün bu bilgileri güçlükle sindirebilmekte ve ayrıntılı bir araştırmayı bağımsız olarak yönetebilmekte güçlüklerle baş etme durumundadır. Buna ek olarak çoklu veri tabanlarında sorgulamada, anlambilim, veri modelleri, ulaşım mekanizmaları ve sorgulama dili gibi uyumsuzluğa yol açan birçok engeller mevcuttur. Sinirbilim ile ilgili veri kaynaştırma ve veri tabanlarının işlerliğini sağlama yönünde sorunu çözmek üzere internet üzerinden ulaşılabilen NILS (Neuroinformatics Literature System=Sinirbilim-Bilgi Kaynak Sistemi) ile nörolojik görüntüleme ve beyin işlevleri araştırmalarında kullanıcıya çoklu ortamdan sonuç çıkartıcı, koordine edici, analiz eden ve bilgiyi kayıtlayan yarı-otomatik, yerel, hızlı çalışan bir ortama nakile çalışmaktayız ve bu sistemi geliştirmekteyiz. NILS bilgi buluşu için tasarlandı ve 8 ana işlev modülünden oluşmaktadır: Bunlar sistem bakımı, kaynak yenileme, kaynak düzeltme, sonuç sunumu, kaynak bilgi analizi, sinir görüntüleme bütünleşmesi, metin bulmada nöroinformasyon ve sinir ontoloji prototip yapımıdır. Bilgiyi yarı-otomatik anlam çıkarma, koordine etme, analiz ve depolamayı olası kılar. Beyinin çalışma prensibini tamamıyla anlama açısından ayrıntılı nörobilimsel bilginin ağını oluşturmada yardımcı olur. Multidisipliner ve çok katmanlı bütünleştiren ve düzelten servis olarak yüksek performanslı tek bir yerel şebekeye bağlar. NILS sadece hipotezle oluşacak gelecekteki çalışma modellerinin kaynağı olmakla kalmayacak, aynı zamanda daha önceleri ender olarak bilinen literatürdeki çeşitli anlamsal ilişkileri, dikkatten kaçan bağlantıların ve ilişkilerin tanınmasını da ortaya çıkaracaktır.