Diffüz ve Yüksek Dereceli Glial Tümörlerde miRNA Ekspresyon Değişimlerinin Belirlenmesi

Cumhur GÜNDÜZ, Sunde SÜSLÜER YILMAZ, Çağla KAYABAŞI, Çığır AVCI BİRAY, Zeynep Özlem ŞIĞVA DOĞAN, Tuğçe BALCI, Tayfun DALBASTI, Taner AKALIN

Abstract

Objective: It was aimed to determine the expression profiles of miRNAs in patients withdiffuse and anaplastic brain tumors.Methods: miRNA expression profiles of 50 cases (19 Female, 31 Male) diagnosed with braintumor [32 Glioblastoma (GBM), 10 diffuse astrocytoma (DA), 8 anaplasticoligodendroglioma (AO)] in Ege University, Department of Neurosurgery and of brain tumorcell lines (U-87 MG, U-118 MG and LN 18) studied by the microarray method.Results: In all cases miR-21 expression level was high and no miR-124 expression wasdetected. In GBM, miR-495 and miR-432 expression showed significant 2-fold increase, andmiR-708-3p, mir-339-5p and miR-4286 expressions 4-fold, mir-331-3p, miR-625-3p, andmiR-20a-3p showed 5-fold reduction compared to cell lines. miRNA expressions comparedGBM and AO, it was detected that miR-34c-3p, miR-132-5p, mir-605, miR-3130-3p, miR- 3127, mir-517a-pre, mir-548b-3p, miR-921, miR-769-5p were significantly increased. mir- 204 expression was significantly decreased in AO compared to cell lines. In DA, miRNAexpression was significantly increased in 18 and decreased in 7. There was no significantmiRNA expression changes in AO compared with DA. miRNA expressions of DA, AO andGBM cases were compared and significant alterations were found in 29 miRNA expressions.Conclusion: miRNA expression profiles of GBM were significantly different from AO. Itwas emphasized that, new genes could be effective in tumor development supposed to beregulated by miRNAs. New specific gene targets regulated by miRNA expression could bepredicted good clinical outcome in brain tumors.

Özet

Amaç: Bu çalışmada diffüz ve anaplastik beyin tümörlü olgularda miRNA ekspresyonprofillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Metot: Ege Üniversitesi Nöroşirurji Anabilim Dalı'nda 2007-2011 yılları arasında beyintümörü tanısı almış 50 (19K, 31E) olgunun [32 glioblastoma (GBM), 10 diffüz astrositom(DA) ve 8 anaplastik oligodendrogliom (AO)] ve beyin tümörü hücre hatlarının (U-87 MG,U-118 MG ve LN 18) miRNA ekspresyon profilleri mikroarray yöntemi ile çalışıldı.Bulgular: miR-21 ekspresyonunun tüm olgularda yüksek düzeyde olduğu ve mir-124ekspresyonunun olmadığı bulundu. GBM tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları hücrehatları ile karşılaştırıldığında miR-495 ve miR-432 ekspresyonları 2 kat anlamlı artma vemiR-708-3p, mir-339-5p ve miR-4286 ekspresyonları 4 kat, mir-331-3p, miR-625-3p ve miR- 20a-3p 5 kat azalma gösterdi. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları GBM tanısıalmış olguların miRNA ekspresyonları ile karşılaştırıldığında miR-34c-3p, miR-132-5p, mir- 605, miR-3130-3p, miR-3127, mir-517a-pre, mir-548b-3p, miR-921, miR-769-5pekspresyonunda anlamlı artma saptandı. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonlarıhücre hatları ile karşılaştırıldığında; mir-204 ekspresyonunun 6 kat anlamlı olarak azaldığıbelirlendi. DA tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları hücre hatları ilekarşılaştırıldığında 18 miRNA ekspresyonunda anlamlı artma ve 7 miRNA ekspresyonundaanlamlı azalma gözlendi. AO tanısı almış olguların miRNA ekspresyonları DA tanısı almışolguların miRNA ekspresyonları ile karşılaştırıldığında, anlamlı değişim saptanmadı. DA, AOve GBM olgularının miRNA ekspresyonları karşılaştırıldığında, 29 miRNA ekspresyonununanlamlı farklılık gösterdiği bulundu.Sonuç: miRNA ekspresyon profilleri GBM tanılı olgular ile AO tanılı olgular arasındaanlamlı farklılıklar sergilemiştir. Tümör gelişiminde miRNA' ların regüle ettiği varsayılanyeni genlerin etkili olabileceği vurgulanmıştır. miRNA ekspresyonu tarafından regüle edilenyeni spesifik gen hedefleri beyin tümöründe iyi klinik gidişi belirtebilir.