Evaluation of Rapidec Carba NP test and chromogenic mediaperformances for detecting carbapenemase-producing Enterobacteriaceae

Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae üyelerinin belirlenmesinde kromojenik besiyerleri ve Rapidec Carba NP testin performanslarının değerlendirilmesi

Bedia DİNÇ, Mihriban YÜCEL, Serap YAĞCI, Salih CESUR, Esra KAYA KILIÇ, Çiğdem ATAMAN HATİPOĞLU, Sami KINIKLI, Şerife ALTUN DEMİRCAN

Abstract

Objective: Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains are important agents of health-care associated infections in both our country and worldwide but their detection is difficult. The aim of this study wasto compare Rapidec Carba NP test and new chromogenic media, OXA-48 and Chrom ID Carba agar medium performances for detecting carbapenemase-resistant Enterobacteriaceae isolates. Material and Method: This study was performed in intensive care units (ICU) of a tertiary care training and research hospital. Totally 67 Enterobacteriaceae strains (30 Escherichia coli, 37 Klebsiella pneumoniae) isolated from varies cultures including blood, urine and tracheal aspirate of ICU patients were included to the study. Identification and antibiotic susceptibility tests of the isolates were performed using VITEK- 2 Compact automated system as well disc diffusion test. All isolates were inoculated into chromogenic Chrom ID Carba agar and OXA-48 medium simultaneously. They are incubated at 37°C for 24-72 hours. Color changes were evaluated at 24, 48 and 72. hours. Rapidec Carba NP test was also performed for all isolates according to the recommendations of the manufacturer and then its performance wascompared with chromogenic media. When comparing the methods, carbapenem resistance values determined by disc diffusion and VITEK-2 automated system were accepted as reference. Results: Among 67 isolates, 28 (42%) were found carbapenem-sensitive and 39 (58%) carbapenem-resistant by using disc diffusion and VITEK-2 automated systems. When disc diffusion test and VITEK 2 Compact automated systems were accepted as reference, compliance rate between Rapidec Carba NP test and disc diffusion and VITEK-2 automated system was 93% (62/67) while it was 75% (50/67) between chromogenic media (CARBA ID and OXA-48) and disc diffusion and VITEK-2. When chromogenic Chrom ID Carba agar and OXA-48 medium and Rapidec Carba NP test were evaluated together, their compliancerate with disc diffusion and VITEK-2 automated system was 69% (46/67). Conclusions: In this study we found close to 70% compliance between Chrom ID Carba agar medium, OXA-48 medium and Rapidec Carba NP test results. We believe that the studies involving more isolates should be performed on this subject. Moreover, we think that carbapenem resistance should be confirmed by genotypic tests which are the reference method.

Özet

Amaç: Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae (CPE) suşları ülkemizde ve dünyada önemli bir sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyon etkenidir ve saptanmaları güçlük gösterir. Bu çalışmanın amacı; karbapeneme dirençli Enterobacteriaceae üyelerini saptamada yeni bir kromojenik besiyeri olan Chrom ID Carba agar ve OXA-48 agar besiyerleri ile Rapidec Carba NP testin performansının karşılaştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitesi’nde yatan hastaların çeşitli klinik örneklerinden (derin trakeal aspirat, kan, idrar vb.) izole edilen ve karbapenem direnci fenotipik olarak disk difüzyon ve VITEK-2 Compact otomatize identifikasyon ve antibiyotik duyarlılık sistemi ile saptanan 67 Enterobacteriaceae suşu (30 Escherichia coli, 37 Klebsiella pneumoniae) dahil edildi. İzole edilen 67 suşun disk difüzyon yöntemi ve VITEK-2 otomatize sistemi ile 28 (%42)’inin karbapeneme duyarlı, 39 (%58)’unun ise en az bir karbapenem grubu antibiyotiğe dirençli olduğu saptandı. Şuslar eş zamanlı olarak Chrom ID Carba agar ve OXA-48 besiyerlerine ekildi. Suşlar 37°C’de etüvde 24-72 saat süreyle inkübe edildi. Renk değişimleri 24, 48 ve 72. saatlerde değerlendirildi. İzole edilen suşlarda Rapidec Carba NP testi de çalışılarak kromojenik agar besiyerleri ile performansları karşılaştırıldı.RapidecCarbaNP testi üretici firmanın önerileri doğrultusunda çalışıldı. Her iki yöntemin karşılaştırılmasında disk difüzyon yöntemi ve VITEK-2 otomatize sistemiyle saptanan karbapenem direnç sonuçları referans olarak kabul edildi. Bulgular: Toplam 67 izolatın, disk difüzyon yöntemi ve VITEK-2 otomatize sistemiyle 28 (%42)’inin karbapeneme duyarlı; 39 (%58)’unun ise karbapeneme dirençli olduğu belirlendi. Disk difüzyon yöntemi ve VITEK- 2 otomatize sistemi referans alındığında; Rapidec Carba NP testin uyum oranı %93 (62/67) iken;kromojenik besiyerleri (Chrom ID Carba agar ve OXA-48 agar) ile disk difüzyon yöntemi ve VITEK-2 Compact otomatize yöntemleri arasındaki uyum oranı %75 (50/67) idi. Disk difüzyon yöntemi ve VITEK- 2 otomatize sistemi referans alındığında kromojenik Chrom ID Carba agar ve OXA-48 agar besiyerleri ile Rapidec Carba NP testi arasındaki uyum oranı %69 (46/67) olarak belirlendi. Sonuç: Karbapeneme dirençli Enterobacteriaceae ailesi üyelerinin saptanmasında fenotipik yöntemlerin performansının değerlendirilmesi için, bu testlerin referans yöntem olan genotipik testlerle karşılaştırıldığı daha fazla sayıda suş içeren in vitro çalışmalara ihtiyaç olduğu görüşündeyiz.