The Characterization of Escherichia coli Strains Isolated from Urinary Tract Infections in Cats and Dogs

Üriner Sistem İnfeksiyonlu Kedi ve Köpeklerden İzole Edilen Escherichia coli Suşlarının Karakterizasyonu

Serkan İKİZ, Ebru YALÇIN, Seyyal AK, Arzu Funda BAĞCIGİL, Naciye Yakut ÖZGÜR, Banu DOKUZEYLÜL, Hüban GÖÇMEN

Abstract

The aims of the study were to perform phylogenetic grouping, to detect the virulence associated genes in Escherichia colistrains recovered from the urinary tract infections of dogs and cats, and to determine the antibiotic susceptibility profiles, as well. The urinesamples from the animals showing clinical signs of urinary tract infection examined for the occurrence of E. coli. Phylogenetic classification ofthe isolates was performed according to the existence of chuA, yjaA and TSPE4.C2 genes. The isolates were also examined for the presence ofuropathogenecity-associated genes, such as, fimH, sfa1, iut, fyu, hly, cnf-1, papG and for the diversity of the papG allelles. Finally, theantimicrobial susceptibility profiles were examined. E. coli was isolated from 11 (6.08%) of 181 samples. Two isolates belonged to group A-2,while the remaining isolates belonged to group B-2. hylA was detected in 2 (25%); sfa1, cnf1, papG and papGIII were detected in 3 (37.5%);iutA was detected in 4 (50%); fyuA was detected in 6 (75%); and fimH was detected in all of the isolates. Most of the isolates were resistant toampicillin while one isolate also showed multidrug resistance. The isolation rate of E. coli was low in this study, however, we had a brief dataabout the phylo-groups and virulence factors of canine and feline uropathogenic strains.

Özet

Bu çalışmada kedi ve köpeklerde üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen E. coli izolatlarının filogenetik tiplendirmesinin yapılması, virulansla ilişkili genlerinin saptanması ve antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla üriner sistem şikayeti olan kedi ve köpeklerden idrar örnekleri toplandı ve E. coli yönünden incelendi. İzolatların filogenetik sınıflandırması chuA, yjaA ve TSPE4.C2. gen bölgelerinin varlığına göre yapıldı. Bunu takiben tüm izolatlar üropatojenite ile ilişkili faktörlerden fimH, sfa1, iut, fyu, hly, cnf1, papG varlığı ve papG allellerinin dağılımı yönünden incelendi. Son olarak izolatların antibiyotiklere duyarlılıkları belirlendi. İncelenen 181 idrar örneğinin 11 (% 6,08)’inden E. coli izole edildi. Filogenetik tiplendirme sonucunda izolatların ikisinin A-2 geri kalan altısının B2-2 filogenetik sınıfa ait oldukları saptandı. İzolatların 2 (%25)’sinde hlyA; 3 (%37.5)' ünde sfa1, cnf1, papG ve papGIII; 4 (%50)'ünde iutA; 6 (%75)'sında fyuA ve tümünde fimH saptandı. İzolatların çoğunluğunu ampisiline dirençli olduğu, bir izolatın çoklu direnç gösterdiği saptandı. E. coli izolasyon oranı az olmakla birlikte, bu çalışma sonucunda kedi ve köpeklerdeki üropatojen suşların filogenetik grupları ve virulans faktörleri hakkında ön bilgi elde edildi.