Comparison of the sensitivity of DNA amplification method in paraffin blocks and in sputum for the diagnosis of tuberculosis

Tüberküloz tanısında DNA amplifikasyon testinin balgam ve parafin bloklardaki sensitivitesinin karşılaştırılması

Sema HÜCÜMENOĞLU, Haluk VAHABOĞLU, Haldun VAHABOĞLU, Nur ÇELİK, Mustafa GÜN

Abstract

It is claimed that Polymerase Chain Reaction (PCR) could be used for the rapid diagnosis of tuberculosis in fresh tissue, paraffin blocks, sputum, gastric aspirate and cerebrospinal-fluid. In order to test this claim, sections obtained from paraffin blocks of 40 cases , histopathologically diagnosed as tuberculosis, were stained with Ziehl-Neelsen Method and also PCR was applied to all specimens. In six cases, Mycobacterium tuberculosis was detected with Ziehl-Neelsen stain, but none of the specimens was positive with PCR method. As control, the sputa of 96 patients tentatively diagnosed as tuberculosis with clinical findings and tuberculin skin test were studied with PCR and a positivity in 80 (83%) was obtained. We obtained positive results in 80 (83%) of 96 patients. It is concluded that PCR is not a sensitive method in paraffin blocks of tissues although it is routinely used in sputum and fresh tissues.

Özet

Tüberküloz tanısının kısa sürede konulabilmesi için, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) testinin taze doku, parafin blok, balgam, gastrik aspirat ve serebrospinal sıvıda kullanılabileceği öne sürülmüştür. Bu durumu araştırmak amacıyla histopatolojik olarak tüberküloz tanısı almış 40 olgunun parafin bloklarından yapılan kesitler Ziehl-Neelsen yöntemi ile boyandı ve PCR testi uygulandı. Ziehl-Neelsen boyaması ile altı olguda Mycobacterium tuberculosis basili görülürken, PCR yöntemi ile hiçbirinde pozitiflik izlenmedi. Kontrol grubu olarak, klinik bulgularla ve tüberkülin deri testi ile tüberküloz tanısı konan 96 hastanın balgam örnekleri PCR yöntemi ile incelendi ve 80 (%83) olguda pozitif sonuç alındı. Sonuç olarak, tüberküloz tanısında DNA amplifikasyon testinin balgam ve taze dokuda yaygın olarak kullanılabilmesine karşın, parafin blokta duyarlı olmadığı sonucuna varıldı.