The concordance of laboratory isolates with clinical pictures

Abstract

In order to reach correct results for the evaluation of diseases, both clinical and laboratory data have to be correctly and harmoniously interpreted by clinicians. The purpose of this study was to determine whether the isolates which were interpreted and reported as infection or infectious agent were concordant with clinical diagnosis or not. Totally 909 specimens which belonged to 232 hospitalized patients were randomly chosen and clinical concordance of 1000 isolates identified with the prudence of being infectious agent was investigated. Of the strains 59.5% was found to be concordant with clinical diagnosis while 29.5% were colonisation and 11% were inconcordant with clinical pictures. On the basis of specimen types, the most concordant results were detected in urine samples (94.9%), followed by wound (89.6%), cerebrospinal fluid (77.4%) and blood (70.9%). The least concordant results were obtained with throat specimens (1.3%). Although Staphylococcus aureus was the most frequently isolated microorganism (19.8%), clinical concordance was about 60.1%. The most clinical concordance was detected with Escherichia coli (77.9%). In order to interpret if the growing isolate in laboratory is really the infectious agent or not, laboratory request forms with information on patient and specimen(s) should be carefully filled in. However, it was seen that only 10.1% of the forms carried sufficient information.

Özet

Hastalıkların değerlendirilmesinde doğru sonuçlara ulaşılabilmesi, gerek klinik gerekse laboratuvar verilerin klinisyen tarafından uyumlu ve doğru biçimde yorumlanmasına bağlıdır. Çalışmada, laboratuvarda izole edilen ve infeksiyon veya infeksiyon hastalığı etkeni olarak yorumlanarak rapor edilen kökenlerin klinik yönden değerlendirilip klinik tanı ile uyumlu olup olmadıklarının, dolayısıyla laboratuvarın isabet oranının belirlenmesi amaçlanmıştır. Bunun için laboratuvara gelen örnekler arasında rastgele seçilen 232 yatan hastaya ait 909 örnekten izole edilen ve etken olabileceği öngörüsü ile idantifiye edilen 1000 izolatın klinik uyumu araştırıldı. Suşların %59.5'i klinikle uyumlu bulunurken, %29.5'i kolonizasyon ve %11.0'i klinikle uyumsuz olarak değerlendirildi. Örnek bazında, en fazla uyum idrarda (%94.9) olup bunu yara (%89.6), beyin-omurilik sıvısı (%77.4), kan (%70.9) izlemekte; boğaz (%1.3) ise en sonda yer almaktadır. En sık izole edilen mikroorganizma olan Staphylococcus aureus'un (%19.8) ancak %60.1'inin klinik ile uyumlu olduğu; Escherichia coli'nin ise %77.9 oranı ile en uyumlu izolat olduğu saptandı. Laboratuvarda örneklerde üreyen bakterilerin etken olup olmadığının yorumunu yapabilmek için örnek ve hasta konusunda bilgilerin de yeraldığı istek formlarında yeterli bilginin yeralması gerekirken, bunun ancak %10.1 formda sağlanabildiği belirlendi.