Structural and spectral properties of 4-(4-(1-(4-Hydroxyphenyl)-1-phenylethyl)phenoxy)phthalonitrile: Analysis by TD-DFT method, ADME analysis and docking studies

4-(4-(1-(4-Hidroksifenil)-1-feniletil) fenoksi) ftalonitril’in yapısal ve spektral özellikleri: TD-DFT metodu ile analiz, ADME analizi ve doking çalışmaları

Abstract

Since phthalonitrile compounds have become popular lately, the focus has been on the idea that these compounds should be investigated. A unique phthalonitrile compound, 4-(4-(1-(4-hydroxyphenyl)-1-phenylethyl)phenoxy)phthalonitrile (coded as PN) was selected and molecular modeling studies were carried out on this compound to be brought to the literature. First, time-dependent density functional theory (TD-DFT) calculations (Geometry optimization, HOMO-LUMO, dipole moment calculations, MEPS maps, Mulliken atomic charges, and NBO analysis) were performed for PN. In addition, in this section, absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) analysis for the compound belonging to the phthalonitrile group was performed and the color regions were presented separately. Finally, molecular docking studies were performed for two compounds separately with three different enzymes (AchE, BchE, α-GLY), and docking scores and receptor models were presented.

Özet

Ftalonitril bileşikleri son zamanlarda popüler hale geldiğinden, bu bileşiklerin araştırılması gerektiği fikri üzerinde durulmuştur. Eşsiz bir ftalonitril bileşiği olan, 4-(4-(1-(4- hidroksifenil)-1-feniletil)fenoksi)ftalonitril (PN olarak kodlanmıştır) seçilmiş ve literatüre kazandırılmak üzere bu bileşik üzerinde moleküler modelleme çalışmaları yapılmıştır. İlk olarak, PN için zamana bağlı yoğunluk fonksiyonel teorisi (TD-DFT) hesaplamaları (Geometri optimizasyonu, HOMOLUMO, dipol moment hesaplamaları, MEPS haritaları, Mulliken atom yükleri ve NBO analizi) yapılmıştır. Ayrıca bu bölümde ftalonitril grubu bileşiğe ait absorpsiyon, dağılım, metabolizma, atılım ve toksisite (ADMET) analizleri yapılmış ve renk bölgeleri ayrı ayrı sunulmuştur. Son olarak, bir bileşik için ayrı ayrı üç farklı enzim (AChE, BChE, α-GLY) ile moleküler doking çalışmaları yapılmış ve doking skorları ve reseptör modelleri sunulmuştur.