Relation of chronic atrophic gastritis and intestinal metaplasia with Helicobacter pylori and tumor necrosis factor-? and macrophage migration inhibitory factor polymorphisms in a population of Easten Anatolia

Ali KARAMAN, Bilge GEÇKİNLİ, Hatip AYDIN, Doğan Nasır BİNİCİ, İbrahim PİRİM

Abstract

Objective: We aimed to determine the effects of tumour-necrosis factor-? (TNF-?) and macrophage migration inhibitory factor (MIF) gene polymorphisms, Helicobacter pylori (H. pylori) infection, on the risk of developing chronic atrophic gastritis (CAG) and intestinal metaplasia (IM). Material and Method: The TNF-?-308G/A and MIF-173G/C single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped using polymerase-chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis, in 84 patients (43 CAG and 41 IM) and 40 healthy controls in a region of Eastern Anatolia. Results: An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-?-308 GA genotype, negative for H. pylori infection or TNF-?-308 AA genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with TNF-?-308 GA genotype and negative for H. pylori infection or TNF-?-308 AA genotype and negative for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with TNF-?-308GA genotype , and positive for H. pylori infection. An increased risk of CAG was found in subjects with MIF173GC genotype and negative for H. pylori infection or MIF173CC genotype carriers and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and negative for H. pylori infection. An elevated risk of IM was found in subjects with MIF-173GC genotype and positive for H. pylori infection.Conclusion: Therefore, the TNF-?-308G/A and MIF-173G/C genotyping may be used as biomarkers at the early stage of the gastric cancer.

Özet

Türkiye'de bir doğu populasyonunda kronik atrofik gastrit ve intestinal metaplazi ile tümör nekrozis faktör-? ve makrofaj migrasyon inhibitör faktör gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilorinin ilişkisiAmaç: Kronik atrofik gastrit (KAG) ve intestinal metaplazi (İM) gelişme riskinde tümör nekrozis faktör-? (TNF-?), makrofaj migrasyon inhibitör faktör (MIF) gen polimorfizmleri ve Helikobakteri pilori (H. pilori)'nin etkisini tespit etmek amaçlandı.Gereç ve Yöntem: TNF-?-308G/A ve MIF-173G/C tek nükleotid polimorfizmi Türkiyenin doğusunda bir bölgede 84 hastada (43 KAG ve 41 IM) ve 40 sağlıklı kontrolde polimeraz zincir reaksiyon-restriksiyon fragman uzunluk polimorfizim (PZRRRUP) analizi kullanılarak genotiplendirildi. Bulgular: H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-?-308G/A genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF?-308 AA taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-?-308G/A genotipli olgularda yada H. pilori infeksiyonu negatif ve TNF-?-308AA taşıyıcı olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve TNF-?-308G/A genotipli olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF173GC genotipli olgularda ya da H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173CC taşıyıcı olgularda KAG riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu negatif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu. H. pilori infeksiyonu pozitif ve MIF-173GC genotipli olgularda IM riskinde bir artış bulundu.Sonuç: Böylece, TNF-?-308G/A ve MIF-173G/C genotipleri erken evre gastrik kanserde biyomarkır olarak kullanılabilir.