Anaerobic bacteria isolated f rom clinical specimens: Seven-year review

Klinik örneklerden izole edilen anaerobik bakteriler: Yedi yıllık değerlendirme

Cem ÇELİK, Elif Bilge UYSAL, Mustafa Zahir BAKICI, Çağlar ALAN, Havva KAYA, Mustafa Gökhan GÖZEL

Abstract

Aim. Although anaerobic bacteria are a group of bacteria that can cause significant pathologicalchanges, they are are frequently overlooked due to the difficulties in culturing and isolation. Thisstudy aims to investigate the distributions of anaerobic bacteria isolated from the specimens sent tothe Microbiology Laboratory of the Cumhuriyet University School of Medicine between the years2006-2013 based on a preliminary diagnosis of anaerobic infection. Methods. This study includes543 samples properly collected from various clinics, these samples were retrospectively examinedusing laboratory records. Results. While there was no growth in 409 (75.3%) of the study samples,various anaerobic bacteria were grown on 134 (24.6%) samples. Our study found the highestgrowth rate (29.9%) to be in Bacteroides spp. among the anaerobic bacteria isolated in our study,followed by Peptopstreptococcus spp. (23.1%), and Propionibacterium spp. (20.2%). Conclusions.As a result, although growing anaerobic bacteria is difficult, time-consuming and more expensive,it is possible to isolate a significant amount of anaerobic bacteria as infectious agents when clinicalsamples were properly collected and sent. We consider that describing anaerobic bacteria willallow for a more accurate treatment of such infections. We think that the local data obtained withthis study will offer benefits in following and treating infections caused by anaerobic bacteria andcontribute to the current literature.

Özet

Amaç. Anaerob bakteriler önemli patolojilere neden olabilen bakteriler olmasına rağmen kültür veizolasyonda yaşanan zorluklar nedeniyle sıklıkla gözden kaçmaktadırlar. Bu çalışmada 2006-2013yılları arasında Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına,anaerob infeksiyon ön tanısı ile gönderilen örneklerden izole edilen anaerob bakterilerin,dağılımlarının incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem. Çalışmaya çeşitli kliniklerden anaeobbakterilerin üretimine uygun şekilde alınarak gönderilen 543 örnek dahil edilmiş, örneklerlaboratuvar kayıtlarından geriye dönük olarak incelenmiştir. Bulgular. Çalışılan örneklerin409unda (%75,3) üreme görülmezken, 134 örnekte (%24,6) çeşitli anaerob bakteriler üretilmiştir.Çalışmamızda izole ettiğimiz anaerob bakteriler arasında da en fazla üreyen bakterinin Bacteroidesspp. (%29,9) olduğu görülürken, ikinci sırada Peptopstreptococcus spp. (%23,1), üçüncü sıradaPropionibacterium spp. (%20,2) izole edilmiştir. Sonuç. Anaerob bakterilerin üretilmesi güç,zaman alıcı ve daha pahalı olmasına rağmen klinik örneklerden uygun şekilde alınıpgönderildiğinde önemli miktarda anaerob bakteri infeksiyon etkeni olarak izole edilebilmektedir.Anaerop bakterilerin klinik örneklerden tanımlanması ile anaerop etkenli enfeksiyonların dahaisabetli bir şekilde tedavi edilebilmesine olanak sağlanacağı kanaatindeyiz. Çalışmamız sonucundaortaya koyduğumuz yerel verilerin anaerob bakterilere bağlı infeksiyonların takip ve tedavisindeyarar sağlayarak bu konudaki literatüre katkı sunacağını düşünüyoruz.