Biological Control of Root and Crown Rot Disease of Strawberry (Phytophthora cactorum) with Rhizobacteria

Çilekte Kök ve Taç Çürüklüğü Hastalığı (Phytophthora cactorum)’na Karşı Kök Bakterileri ile Biyolojik Mücadele

Abstract

Phytophthora Root and Crown Rot (Phytophthora cactorum) is one of the diseases of strawberry that limit production. This study aims to use antagonistic bacteria against the disease. For this purpose, a total of 362 bacteria were isolated from the rhizosphere of strawberry, cauliflower, red cabbage, broccoli, cabbage, radish, wild radish, broad bean, barnyard grass, and shepherd’s purse plants. The number of bacteria studied was reduced to 101 and then to 24 according to dual culture and pre-tests. In tests to determine the mode of actions of these antagonists; out of 24 bacteria, none of the isolates produced chitinase, cellulase, and pectinase, while 13 produced protease, 19 produced HCN, 18 produced siderophore, 11 produced biosurfactant, 16 produced 2-4 DAPG, 2 produced IAA (62.4 ve 1.9 µg/ml). Three antagonists had a phosphatase activity. Twenty had able to solubilize inorganic phosphorus. All bacteria were identified as Pseudomonas spp. 3ss9 and 6l10 reduced the disease severity by %50 in pots trials.

Özet

Phytophthora kök ve taç çürüklüğü (Phytophthora cactorum) çilek üretimini sınırlayan hastalıklardan bir tanesidir. Bu çalışma hastalık ile mücadelede antagonist bakterilerin kullanılmasını hedeflemektedir. Bu amaçla; çilek, karnabahar, kırmızı lahana, brokoli, lahana, turp, bakla ile yabancı otlardan yabani turp, darıcan ve çoban çantası bitkilerinin kök bölgesinden toplam 362 adet bakteri izole edilmiştir. Yapılan ikili kültür ve bazı ön eleme testleri ile çalışılan bakteri sayısı 101’e daha sonra da 24 düşürülmüştür. Bu antagonistlerin sahip oldukları etki mekanizmalarını belirlenmeye yönelik testlerde; hiç bir izolatın kitinaz, selülaz ve pektinaz aktivitesine sahip olmadığı, 13 izolatın proteaz, 3 izolatın fosfataz aktivitesine sahip olduğu, 20 izolatın inorganik fosfatı çözebildiği saptanmıştır. 19 izolatın HCN, 18 izolatın siderofor, 11 izolatın yüzey aktif madde ve 16 izolatın da 2-4,DAPG ürettiği bulunmuştur. Antagonistlerin IAA üretim kabiliyetlerine bakıldığında 62.4 ve 1.9 µg/ml olarak iki izolatın IAA ürettiği belirlenmiştir. Tüm bakteriler Pseudomonas spp. olarak tanılanmıştır. Saksı denemelerinde 3ss9 ve 6l10 izolatlarının P. cactorum’a karşı %50 oranında bir engelleme gösterdiği bulunmuştur.