SavedAdd your journal

Journals / Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 65 - Sayı: 4

Phylogenetic Analysis of Salmonella Infantis Strains from Poultry by Multilocus Sequence Typing

Kanatlı kökenli Salmonella Infantis suşlarının multilokus dizi tiplendirmesi ile filogenetik analizi

Seyyide SARIÇAM, Hamit Kaan MÜŞTAK

Pages
407–411
DOI
—

Abstract

In this study, it was aimed to evaluate the 20 Salmonella Infantis strains isolated from broiler chicken hutches (base, dust, environment, rodent traps, feed and water samples) by Multilocus Sequence Typing (MLST). Six different serovars were used to exhibit the evolutionary relationship between different sequence types (ST) and serotypes on phylogenetic tree. All S. Infantis strains were found as ST32 as a result of MLST analysis performed on 7 housekeeping genes belonging to each subspecies and ST32 was thought to be the dominant sequence type for S. Infantis in Turkey. The other serotypes; S. Enteritidis, S. Typhimurium, S. Hadar, S. Agona, S. Mbandaka and S. Coeln was found to be ST11, ST19, ST33, ST13, ST413 and ST2015, respectively. In this study, S. Agona, S. Mbandaka and S. Coeln serotypes were typed with the MLST for the first time in Turkey. Serotype information of ST2015 was registered to the MLST database for S. Coeln serotype.

Özet

Bu çalışmada broyler tavuk kümeslerinin altlık, toz, çevresel, kemirici kapanları, yem ve su örneklerinden izole edilen 20 adet Salmonella Infantis suşunun multilokus dizi tiplendirme (MLST) ile tiplendirilmesi amaçlandı. Sekans tipleri (ST) ve serotipler arasındaki evrimsel ilişkiyi göstermek amacıyla yapılan filogenetik analizde, 6 farklı serotip çalışmaya dahil edildi. Her bir suşa ait 7 housekeeping gen üzerinden gerçekleştirilen MLST analizi sonucunda tüm S. Infantis suşları ST32 bulundu ve Türkiye’de S. Infantis için baskın sekans tipi olabileceği sonucuna varıldı. S. Enteritidis ST11, S. Typhimurium ST19, S. Hadar ST33, S. Agona ST13, S. Mbandaka ST413 ve S. Coeln ST2015 bulundu. S. Agona, S. Mbandaka ve S. Coeln serotipleri Türkiye’de ilk kez bu çalışmada, MLST ile tiplendirildi. İlk kez bu çalışma ile ST2015 için serotip bilgisi S. Coeln olarak MLST veritabanına girildi.