Journals / Turkish Journal of Gastroenterology / 2008 / Cilt: 19 - Sayı: 3

Mersin’de mide biyopsi örneklerindeki Helikobakter pilori’nin 23S rRNA’sında nokta mutasyonu ve klaritromisin direncinin PCR-RFLP analizi ile gösterilmesi

Detection of point mutations on 23S rRNA of Helicobacter pylori and resistance to clarithromycin with PCR-RFLP in gastric biopsy specimens in Mersin, Turkey

Pages
163–167
DOI
—

Abstract

Background/aims: Helicobacter pylori infection has a high prevalence and is considered an important health problem in Turkey. Unfortunately, an effective treatment has not yet been found for the eradication of Helicobacter pylori infection, at least in our country. Standard therapies recommended for the eradication of Helicobacter pylori have failed in the province of Mersin, Turkey. The rate of eradication with the standard triple treatment was only 45% in the province of Mersin. It may be that Helicobacter pylori has become resistant to antibiotics. Therefore, we aimed to determine the rate of resistance to clarithromycin in the province of Mersin. Methods: The study included 92 patients presenting with dyspepsia to the Gastroenterology Clinic of Mersin University Medical School and undergoing endoscopy. We obtained gastric biopsy specimens and investigated whether Helicobacter pylori was present and resistant to clarithromycin. We used polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism to determine A2143G and A2144G mutations and resistance to clarithromycin. Results: Out of 92 specimens, 37 (40.2%) had Helicobacter pylori DNA. Out of 37 specimens with Helicobacter pylori DNA, 15 (40.5%) had point mutations. Eleven specimens (29.7%) had mutations on nucleotide 2144 and 4 specimens (10.8%) had mutations on 2143. Conclusions: Taking account of the failure of the treatment regimens used to eradicate Helicobacter pylori infection in the province of Mersin, the high rate of point mutations determined in this study was not surprising and the rate of resistance to clarithromycin was an important indicator for the failure in the eradication of Helicobacter pylori infection

Özet

Amaç: Helikobakter pilori infeksiyonu ülkemizde yüksek prevalansa sahip olup önemli bir sağlık sorunudur. Maalesef, Helikobakter pilori eradikasyonu için en azından ülkemizde halen etkin bir tedavi bulunamamıştır. Helikobakter pilori eradikasyonu için önerilen standart tedaviler bölgemizde ve ülkemizde başarılı olmamıştır. Standart üçlü tedavi ile ilimizde Helikobakter pilori eradikasyon başarısı %45’te kalmıştır. Bu Helikobakter pilori’nin antibiyotiklere karşı dirençli olmasına bağlı olabilir. Bu amaçla Mersin’de klaritromisine karşı gelişen direnç oranını saptamayı amaçladık. Yöntem: Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji Bilim Dalında dispeptik yakı nmalar nedeniyle endoskopi yapılan 92 hastadan alınan mide biyopsi örneklerinde Helikobakter pilori varlığı ve klaritromisin direnci araştırıldı. Bu çalışmada A2143G ve A2144G mutasyonu ve buna bağlı olarak ortaya çıkan klaritromisin direncinin sıklığını, polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism ile inceledik. Bulgular: Doksaniki örneğin 37 (%40.2) tanesinde Helikobakter pilori DNA’sı tespit edildi. Bu 37 Helikobakter pilori PCR örneğinden 11’inde (%29.7) nükleotid 2144’te ve 4’ünde (%10.8) 2143’te olmak üzere toplam 15 (%40.5) hastada nokta mutasyonu saptandı. Sonuç: Bölgemizdeki eradikasyon tedavi yetersizliğini göz önüne aldığımızda, %40.5 gibi yüksek oranda saptadığımız Helikobakter pilori klaritromisin direnci beklendiği gibi yüksek çıkmı ş ve klaritromisin direncinin eradikasyon başarısızlığını açıklayabilecek önemli bir bulgu olduğunu göstermiştir.

Keywords: Anti-bakteriyel ajanlar,Biyopsi,Polimorfizm, kesim parçacığı uzunluk,Helicobacter pylori,Helicobacter enfeksiyonları,Klaritromisin,Nokta mutasyonu,RNA, ribozomal,İlaç direnci, bakteriyel,Polimeraz zincir reaksiyonu,RNA, bakteriyel,İlaç tedavisi, kombinasyon