Journals / Turkish Journal of Gastroenterology / 2013 / Cilt: 24 - Sayı: 1
Doğu Çin'deki klaritromisine primer ve sekonder dirençli suşlarda 23S rRNA gen mutasyonunun karakterizasyonu
- Pages
- 5–9
- DOI
- —
Abstract
Background/aims: Clarithromycin is an effective antibiotic for treating Helicobacter pylori; however, the development clarithromycin-resistance by multiple strains prevents the eradication of Helicobacter pylori. We aimed to characterize mutations in the 23S rRNA gene of primary clarithromycin-sensitive, primary clarithromycin-resistant and secondary clarithromycin-resistant Helicobacter pylori strains that were collected in East China and elucidate the mechanisms of clarithromycin resistance. Materials and Methods: The disk diffusion test and E-test method were used to determine the clarithromycin susceptibility of clinical Helicobacter pylori strains. The 23S rRNA gene fragments were amplified by polymerase chain reaction from 18 primary clarithromycin-resistant strains, 15 primary sensitive strains and 8 secondary clarithromycin-resistant strains. Polymerase chain reaction-products were sequenced to determine mutations of the 23S rRNA gene. Results: We found an A2143G (8 strains) mutation in primary clarithromycin-resistant strains, an A2143T (5 strains) mutation in secondary clarithromycin-resistant strains; but no mutations were found in position 2143 of sensitive strains. A T2182C mutation in primary clarithromycin-sensitive, primary clarithromycin- resistant and secondary clarithromycin-resistant strains was found with a prevalence of 86.7% (13 strains), 72.2% (13 strains) or 87.5% (7 strains), respectively. In addition, we found a G2254T (8 strains) and a G2172T (7 strains) mutation in secondary clarithromycin-resistant strains. These point mutations were absent in primary clarithromycin-resistant and -sensitive strains. Conclusion: The gene mutation in position 2143 was associated with resistance to clarithromycin, but the mutation was different between primary and secondary clarithromycin-resistant strains. The T2182C mutation was not associated with clarithromycin resistance. Two new hotspot mutations: G2254T and G2172T, in 23S rRNA were discovered in secondary clarithromycin-resistant strains.
Özet
Amaç: Klaritromisin, Helikobakter pilori eradikasyonunda kullanılan etkin bir antibiyotiktir. Ancak, klaritromisin direnci Helikobakter pylori eradikasyonunu ciddi şekilde zayıflatmaktadır. Amacımız, Do¤u Çin'den toplanan primer klaritromisin hassas, klaritromisin dirençli ve sekonder klaritromisin dirençli Helikobakter pilori suşlarındaki 23S rRNA gen mutasyonlarını karakterize etmek ve klaritromisin direnç mekanizmalarını araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Klinik Helikobakter pilori suşlarında klaritromisin duyarlılı¤ını ölçmek için disk difüzyon testi ve E-Test yöntemleri kullanılmıştır. 23S rRNA gen parçacıkları primer klaritromisin dirençli, hassas ve sekonder klaritromisin dirençli suşlarından polimeraz zincir reaksiyonu ile amplifiye edilmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu ürünleri 23S rRNA gen mutasyon karakteristiklerinin belirlenmesi için sekanslanmıştır. Bulgular: Primer klaritromisin dirençli suşlarda A2143G (8/18) mutasyonu, sekonder Klaritromisin dirençli suşlardan A2143T (5/8) mutasyonu bulunmuş; ancak Klaritromisin hassas suşlarda 2143 pozisyonunda (0/15) mutasyon bulunmamıştır. T2182C mutasyonu primer klaritromisin hassas, dirençli ve sekonder klaritromisin dirençli suşlarda sırasıyla 13/15 (86.7%), 13/18 (72.2%) ve 7/8 (87.5%) bulunmuştur. Ek olarak sekonder klaritromisin dirençli suşlarda G2254T (8/8) ve G2172T (7/8) mutasyonu saptanmıştır. Bu nokta mutasyonları, primer klaritromisin rezistan ve hassas suşlarda saptanmamıştır. Sonuç: 2143 pozisyonundaki gen mutasyonu klaritromisin direnciyle ilişkilidir, ancak primer ve sekonder klaritromisin dirençli suşlardaki mutasyon tipi farklıdır. T2182C mutasyonu klaritromisin direnciyle ilişkili de¤ildir. Sekonder klaritromisin dirençli suşlarda 23SrRNA'da keşfedilen iki yeni hassas nokta mutasyonu G2254T ve G2172T'dir.