HEMATOLOJİK MALİGNİTELERDE KONVANSİYONEL SİTOGENETİK, MOLEKÜLER SİTOGENETİK VE MOLEKÜLER GENETİK SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

EVALUATION OF CONVENTIONAL CYTOGENETIC, MOLECULAR CYTOGENETICS AND MOLECULAR GENETICS RESULTS IN HEMATOLOGICAL MALIGNANCES

Pınar ASLAN KOŞAR,Muhammet Yusuf TEPEBAŞI,Barbaros YİĞİT,Emine Güçhan ALANOĞLU

Abstract

Amaç Hematolojik maligniteler, kemik iliği kaynaklı hücrele rin neoplazmlarıdır. Epidemiyolojik ve klinik çalışma lar sonucunda somatik hücrelerde meydana gelen mutasyonların, bu malignitelerin çoğunda sayısal ve yapısal kromozomal anomaliler ile spesifik gen düze yindeki değişiklikler içerdiğini göstermektedir. Oluşan bu değişikliklerin hematolojik malignensilerin tanı ve takibinde aynı zamanda tedavi seçimi ve progno zu belirlemede kritik role sahip olduğu belirlenmiştir. Çalışmamız, hematolojik maligniteye sahip hasta gu ruplarında kromozomal ve moleküler olarak meydana gelen bu genetik değişikliklerin neler olduğunu tespit etmeyi amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntem Bu çalışmaya Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fa kültesi Hematoloji Anabilim Dalı'na hematolojik malig nite ön tanısı veya tanısı ile başvuran 110 hasta dahil edildi. Akut Miyeloid Lösemi (AML), Kronik Miyeloid Lösemi (KML), Kronik Lenfoblastik Lösemi (KLL), Mi yelodisplastik Sendrom (MDS), Kronik Miyeloprolife ratif Neoplazm ( KMPN), Multipl Myelom (MM)/Diğer Plazma Hücreli Neoplazmlar (DPHN) ve Lenfoma hastalıklarına sahip yedi grubun kemik iliği kültürleri yapılarak üç farklı analiz yöntemi ile incelendi. Sayı sal ve yapısal kromozomal değişiklikler sitogenetik kromozom analizi ve Floresan In Situ Hibridizasyon (FISH) yöntemleri ile ve JAK-2 V617F mutasyonu Re al-Time PCR (RT-PCR) ile analiz edildi. Bulgular Sitogenetik ve FISH analizileri sonucunda, KML için t(9;22) mutasyonu %30,8 ve %22,6 oranlarında, AML için t(15;17) %7,7 oranında pozitif bulundu. Ayrıca, MDS için del (5q) ve del (7q) değerlendirildi ve deles yon saptanmadı. Hastalar del(13q14) ve del(17p13) açısından değerlendirildiğinde, lenfoma (%28,6 ve %71,4) KLL (%50 ve %62,5) ve MPHN (%50 ve %85,7) hastalarında değişen oranlarda bulundu. Ay rıca RT-PCR sonuçlarına göre JAK-2 V617F mutas yonu, KML hasta gurubunda (18.8%) KMPN hasta grubunda ise (81.2%) heterozigot positive olarak bu lunmuştur. Sonuç Laboratuvarımızda elde ettiğimiz bulgular ışığında, hematolojik maligniteye sahip hastaların rutinde ça lışılan mevcut genetik analizlerine ek olarak belirle diğimiz mutasyonlarında incelenmesi ve hasta grup larının da genişletilerek çalışılmasının hastalığın tanı ve prognozunun değerlendirilmesine katkıda buluna cağını düşünmekteyiz.

Özet

Objective Hematological malignancies are neoplasms of bone marrow-derived cells. Epidemiological and clinical studies show that the mutations occurring in soma tic cells include numerical and structural chromoso mal abnormalities and specific gene-level changes in most of these malignancies. It has been determined that these changes have a critical role in the diagno sis and follow-up of hematological malignancies, as well as in the choice of treatment and determining the prognosis. Our study aims to determine what these genetic changes occur as chromosomal and molecu lar in patient groups with hematologic malignancy. Materials and Methods In this study, 110 patients who were admitted to the Department of Hematology of the Süleyman Demirel University Faculty of Medicine with a pre-diagnosis or diagnosis of Hematologic Malignancy were included. Three different analyses applied to the cultured bone marrow tissue samples of seven groups of hemato logy patients who suffered from Acute Myeloid Leuke mia (AML), Chronic Myeloid Leukemia (CML), Chro nic Lymphoblastic Leukemia (CLL), Myelodysplastic Syndrome (MDS), Chronic Myeloproliferative Ne oplasm (CMPN), Malignant Plasma Cell Neoplasm (MPCN) and Lymphoma diseases. Numerical and structural chromosomal changes were examined by cytogenetic chromosome analysis and Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) methods and JAK-2 V617F mutation was analyzed by Real-Time PCR (RT-PCR). Results As a result of cytogenetic and FISH analyzes, the t(9;22) mutation was found to be 30.8% and 22.6% positive for CML, and t(15;17) was found to be positive at 7.7% for AML. Also, del(5q) and del(7q) were eva luated for MDS and no deletion was detected. When the patients were evaluated in terms of del (13q14) and del (17p13), varying rates were found in lymp homa (28.6% and 71.4%) CLL (50% and 62.5%) and MPHN (50% and 85.7%) patients. Also, according to the results of RT-PCR, the JAK-2 V617F mutation was found as heterozygous positive in the CML pa tient group (18.8%) and CMPN patient group (81.2%). Conclusion In the light of the findings we have obtained in our la boratory, we think that examining patients with hema tological malignancies in addition to the existing ge netic analyzes that are routinely studied and studying the patient groups by expanding them will contribute to the evaluation of the diagnosis and prognosis of the disease.