Farklı Böbrek Kanseri Alt Tiplerinde SARS-CoV-2 Hedeflerinin Genetik ve Epigenetik Konsepti

Genetic and epigenetic concept of SARS-CoV-2 targets in different renal cancer subtypes

Abstract

Amaç: SARS-CoV-2 virüs ve konakçı hücre interaksiyonu nun tanımlamasındaki son genetik gelişmeler, ACE2 proteinini ve TMPRSS2, FURIN, CD147/BSG’yi içeren en az 3 ek virüs istila geninin varlığını göstermiştir. Bu çalış mada, hedef genlerde genetik ve epigenetik mekanizma ile farklı böbrek kanseri alt tiplerinin SARS-CoV-2 enfeksiyo nunun duyarlılığı arasındaki ilişki değerlendirilecektir. Gereç ve Yöntemler: Hedef genlerimizin mutasyon profi lini ve m-RNA ekspresyon paternini araştırdık. Ek olarak, hedef genlerin promotör metilasyon profilleri UALCAN veritabanında test edilmiştir. Bulgular: ACE2, TMPRSS2, CD147/BSG ve FURIN dahil olmak üzere hedef genlerin toplam genetik anomali taşıma oranı % 1,6 bulundu ve tespit edilen 7 mutasyondan 1 tanesi patojenik özelliğe sahipti. Gen ekspresyon analiz sonuçlarına göre farklı böbrek kanseri gruplarında; TMPRSS2 düzeyi KIRC ve KIRP hasta grubunda sağlıklı kontrole göre istatistiksel olarak anlamlı olarak düşerken, ACE2 düzeyi KIRC ve KIRP’de yüksek bulundu. CD147/BSG ekspresyonu, KICH hastalarındaki sağlıklı daha yüksektir. KIRC ve KIRP’deki ACE2 hızlandırıcı metilasyon seviyele rinin azaldığı görüldü. Sonuç: Böbrek kanseri hastalarının prognozunu kötüleş tirebilecek SARS-CoV-2 enfeksiyonuna daha duyarlı olabileceği sonucuna varılmıştır.

Özet

bjectives: Recent advances in defining the genetic landscape of has shown the host cell- SARS-CoV-2 inte raction via ACE2 protein and the presence of at least three additional virus invasion genes including TMPRSS2, FURIN, CD147/BSG. In current study, we investigated the mutation and m-RNA expression patterns of target genes by evalua ting the associations between genetic and epigenetic mec hanisms in the target genes and susceptibility of SARS-CoV 2 infection of renal cancer subtypes. Methods: We investigated the mutation and m-RNA exp ression patterns of our target genes. The promoter methy lation profiles of target genes were tested in the UALCAN database. Results: The total rate of carrying genetic anomaly in the target genes including was 1.6% and seven mutations, one of which had a pathogenic feature, were detected. The expression analysis results in renal cancer groups showed that while the KIRC and KIRP patients had a lower level of TMPRSS2 than the healthy control, their ACE2 level was high. KICH patients had a higher level of CD147/BSG expression than the healthy group. The promoter methylation levels of ACE2 in KIRC and KIRP were reduced. Conclusions: We concluded that renal cancer patients may be more sensitive to SARS-CoV-2 infection, which may worsen the prognosis.