Journals / Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dergisi / 2005 / Cilt: 34 - Sayı: 4

ANALYSIS OF SEVERAL INDOLE DERIVATIVES AS P56LCK TYROSINE KINASE INHIBITORS BASED ON DOCKING STUDIES

ÇEŞİTLİ İNDOL TÜREVLERİNİN P56LCK TİROZİN KİNAZ İNHİBİTORLERİ OLARAK DOKİNG ÇALIŞMALARI İLE ANALİZİ

Pages
231–249
DOI
—

Abstract

A series of 3-(substituted-benylidene)-1,3-dihydroindole-2-one, 3-(substituted-benylidene)-1,3dihydroindole 2-thione and bisthio 3-(substituted-benylidene)-1,3-dihydroindole derivatives were investigated as inhibitor of p56Lck by performing receptor docking studies. Some compounds were shown to be docked at the site, where the selective inhibitor PP1 [1-tert-Butyl-3-p-tolyl-1H-pyrazolo[3, 4d]pyrimidine-4-yl-amine] was embedded at the p56Lck. Evaluation of all compounds for active site interactions with lowest binding energy level, capability of hydrogen bond formation and superimposibility on enzyme active site by docking studies, it was concluded that 3-(substituted-benzylidene)-1,3dihydroindol-2-thione derivatives would have good interaction with enzyme active site and have more biological activity

Özet

Bir seri 3-(sübstitüe-benziliden)-1,3-dihidroindol-2-on, 3-(sübstitüe-benziliden)-1,3-dihidroindol-2tiyon ve bistiyo 3-(sübstitüe-benziliden)-1,3-dihidroindol türevleri p56Lck inhibitörleri olarak reseptör doking çalışması ile araştırıldı. Bazı bileşiklerin seçici bir inhibitor PP1[1-t-Butil-3-p-tolil-1Hpirazolo[3,4-d]pirimidin-4-il-amin]’in etkileştiği p56Lck’ın enzim aktif yöresine yerleştiği gözlendi. Bileşiklerin tümünün enzim aktif yöresi ile etkileşimlerinin, en düşük enerji seviyeleri, hidrojen bağı yapma kapasiteleri ve aktif yöreye yerleşme kabiliyetlerinin doking çalışması ile değerlendirilmesi sonucunda, 3(sübstitüe-benziliden)-1,3-dihidroindol-2-tiyon türevlerinin enzim ile etkileşimlerinin ve biyolojik aktivitelerinin daha iyi olabileceği sonucuna varıldı

Keywords: Reseptör tirozin kinaz, p56Lck, N-Sübstitüe indol türevleri, doking