Journals / Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi / 2019 / Cilt: 16 - Sayı: 1
Genetic Characterization of Sainfoin (Onobrychis viciifolia) Varieties and Populations Using Microsatellite Markers
- Pages
- 51–60
- DOI
- —
Abstract
The sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.), which is widely grown in our country especially in the Central and Eastern Anatolianregions, is used for animal feed, improving the structure of soil and nectar source for bees. In this study, genetic structure of twocultivars (Özerbey and Lütfübey) and three populations (Pleven, Kırşehir-1 and Kırşehir-2) were investigated using 10 SSR loci.All of the SSR loci used in the study were polymorphic. A total of 68 alleles were identified in 91 samples analyzed. Geneticdiversity parameters such as; mean number of alleles per locus (Na=1.365), effective allele number (Ne=1.348), Shannoninformation index (I=0.322), Nei’s genetic diversity level (h=0.210), and Nei’s unbiased genetic diversity level (uh=0.222)were calculated. It was observed that the genetic diversity of the populations was mainly due to within population variation(92%) and the remaining portion was due to variation between populations (8%). According to the UPGMA dendrogramobtained from the study, Özerbey and Lütfübey occurred in one cluster, Pleven and Kırşehir-2 populations occurred in thesecond cluster. The results obtained from this study provided important information on the genetic structure of the studiedsainfoin populations.
Özet
Ülkemizin özellikle İç ve Doğu Anadolu bölgelerinde yaygın bir şekilde yetiştiriciliği yapılan korunga (Onobrychis viciifoliaScop.) hayvan beslenmesinde, toprak yapısını iyileştirmede ve arılar için nektar kaynağı olarak önemli bir baklagildir. Buçalışmada ülkemizin tescilli çeşitleri Özerbey ve Lütfübey’de, Kırşehir bölgesinden elde edilmiş iki yerel populasyonda(Kırşehir-1, Kırşehir-2) ve Bulgaristan’a ait Pleven populasyonunda 10 SSR lokusu kullanılarak çeşit ve populasyonlarıngenetik yapısı incelenmiştir. Çalışmada kullanılan 10 SSR lokusunun tamamı polimorfik olarak saptanmıştır. Analiz edilen91 örnekte toplam 68 allel tespit edilmiştir. Genetik çeşitlilik parametrelerinden, lokus başına düşen ortalama allel sayısı(Na=1.365), etkili allel sayısı (Ne=1.348), Shannon Sabiti (I=0.322), Nei’nin genetik çeşitlilik değeri (h=0.210) ve Nei’nintarafsız çeşitlilik değeri (uh=0.222) hesaplanmıştır. Populasyonların genetik çeşitliliğinin büyük oranda (%92) populasyoniçerisinde olduğu, populasyonlar arası çeşitliliğin ise çok düşük olduğu (%8) gözlenmiştir. Çalışma sonucunda elde edilenUPGMA dendrogramına göre birbirine yakın bulunan Özerbey ve Lütfübey bir grup, Pleven ve Kırşehir-2 ayrı bir grup olarakbelirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar türün genetik yapısı hakkında önemli bilgiler vermiştir.