Kandidemi Etkeni Candida albicans Suşlarının Moleküler Yöntemlerle Tiplendirilmesi ve SAP4 Geni Varlığının Araştırılması

Typing of Candidemia Agents of Candida albicans Isolates by Molecular Methods and Investigation of SAP4 Gene Presence

Abstract

Giriş: Son yıllarda mantarlara bağlı infeksiyonlarda ciddi artış dikkati çekmektedir. Özellikle Candida albicans sahip olduğu virülans faktörleri sayesinde en sık karşılaştığımız infeksiyon etkenlerindendir. Ayrıca, C. albicans önemli bir hastane infeksiyonu etkeni olarak, morbidite ve mortalite artışına neden olabilmektedir. Bu çalışmada; kandidemi etkeni C. albicans suşlarının moleküler yöntemler kullanılarak tiplendirilmesi ve bu mikroorganizmaların virülansında önemli bir rolü olan Salgısal Aspartil Proteinaz 4 (SAP4) gen bölgesi varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Çalışmaya kan kültürlerinden izole edilen 50 C. albicans suşu dahil edildi. İzolatlar fenotipik ve genotipik olarak tanımlandı. Suşların moleküler tiplendirilebilmesi için “Arbitrarily Primed” Polimeraz Zincir Reaksiyonu (AP-PCR) ve “Pulsed Field Gel” Elektroforezi–Elektroforetik Karyotip Analizi (PFGE-EK) yöntemleri kullanıldı. Ayrıca C. albicans için bir virülans faktörü olan SAP4 gen varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile araştırıldı. Bulgular: Çalışmaya alınan 50 C. albicans izolatı, AP-PCR yöntemi ile 26, PFGE-EK yöntemi ile 41 genotipe ayrılmıştır ve 50 izolatın 49’unda SAP4 geni varlığı tespit edilmiştir. Sonuç: Sonuç olarak, çalışılan C. albicans izolatlarında baskın bir genotip saptanmamıştır. Her iki moleküler tiplendirme yöntemi sonucunda, C. albicans izolatlarının genellikle endojen kaynaklı olduğu düşünülmektedir. Ayrıca izolatların %98’inde SAP4 geni tespit edilmiştir. Kan örneği izolatlarında önemli oranda bulunması sistemik infeksiyonlarda bu genin katkısı olduğunu düşündürmektedir. C. albicans’ın endojen infeksiyonlarındaki SAP4 geninin işlevi üzerine daha ayrıntılı çalışmalar gelecekte bu infeksiyonların önlenmesine katkı sağlayabilecektir.

Özet

Introduction: In recent years, increasing infections due to fungi have drawn attention. Especially, Candida albicans is the most frequentinfectious agent with its virulence factors. Furthermore, because C. albicans is a nosocomial infection agent, it can lead an increase inmortality and morbidity. In this study, it was aimed to genotype C. albicans strains that caused candidemia by molecular methods andto investigate one of the most important virulence factors, Secreted Aspartyl Proteinase 4 (SAP4).Materials and Methods: Our study included 50 C. albicans strains isolated from blood cultures. The isolates were identified bothphenotypically and genotypically. Arbitrarily-Primed Polymerase Chain Reaction (AP-PCR) and Pulsed Field Gel ElectrophoresisElectrophoretic Karyotype Analysis (PFGE-EK) methods were used for molecular genotyping of the strains. Furthermore, the presence ofSAP4 a virulence factor for C. albicans was investigated by polymerase chain reaction (PCR).Results: The 50 C. albicans isolates included in our study were separated to 26 genotypes by AP-PCR, 41 genotypes by PFGE-EK, andSAP4 was detected in 49 of the 50 isolates.Conclusion: In conclusion, dominant genotypes among the C. albicans isolates were not detected. Results of both molecular typingmethods revealed that C. albicans isolates were generally endogenous. Furthermore, SAP4 gene was detected in 98% of the isolates. Aconsiderable presence of this gene in blood sample isolates suggests that it contributes to systemic infections. More elaborative studieson the function of SAP4 gene in endogenous infections of C. albicans may contribute to the prevention of these infections in the future.