Determination of Nuclear DNA Content of Some Spinach Accessions by Using Flow Cytometer

Flow Sitometri ile Bazı Ispanak Aksesyonlarının Çekirdek DNA İçeriklerinin Belirlenmesi

Abstract

The aim of this research is to determine ploidy levels of 53 spinach (Spinacia oleracea L.) accessions obtained from abroad sources by using flow cytometry. According to the results of the statistical analysis, the differences among DNA content of accessions were statistically important. The average DNA content of spinach accessions used in the study ranged between 2.225 pg/2C (Esfenaj accession) and 2.059 pg/2C (Matador and Godir accessions). The mean nuclear DNA of accessions shown to be relatively stable due to low standard deviation (0.003-0.096). Based on the mitotic chromosome analyses of the some plants with different DNA contents, mitotic chromosome number of the all plants analyzed in the study were determined as 2n=12. These results indicate that all the accessions used in the study are diploid although their DNA content is significantly vary. According to the clustering analysis of the 2C DNA contents results, it was observed that eight sub clusters were formed under two main clusters. The clustering of axioms was performed in a similar manner to the multiple comparison test. As a result, the data will save time and labor convenience in a further breeding studies deal with the same 53 spinach accessions of our study.

Özet

Bu araştırmanın amacı, yurt dışından elde edilmiş olan 53 ıspanak (Spinacia oleracea L.) aksesyonunun flow sitometri ile ploidi düzeylerini belirlemektir. Araştırma verilerine göre; ıspanak aksesyonlarının çekirdek DNA içerikleri arasındaki farklılıkların istatistiki olarak önemli olduğu saptanmıştır. Araştırmada kullanılan ıspanak aksesyonlarının ortalama çekirdek DNA içeriği 2,225 pg/2C (Esfenaj çeşidi) ile 2,059 pg/2C (Matador ve Godir çeşitleri) arasında değişmiştir. Kök ucu meristem dokuları kullanılarak yapılan kromozom sayımlarında analiz edilen tüm bitkilerin 2n=12 kromozoma sahip oldukları ve dolayısıyla diploid oldukları belirlenmiştir. Bu nedenle çalışmada kullanılan aksesyonların tamamının diploid olduğu kabul edilmiştir. 2C DNA içeriklerine göre yapılan kümeleme analizi sonuçlarına göre iki ana küme altında sekiz farklı kümenin oluştuğu görülmüştür. Aksesyonların kümelenmesi çoklu karşılaştırma testinde de benzer sonucu vermiştir. Ispanak aksesyonlarında ploidi seviyelerini belirlemeye yönelik olarak yapılan bu çalışma sonucunda çalışmaya konu olan 53 ıspanak aksesyonu ile ileride yapılacak ıslah çalışmalarında araştırmacılara önemli bir zaman, enerji ve emek tasarrufu sağlayacaktır.