Characterization of Some Inocybe (Fr.) Fr. Taxa Based on Morphological and Molecular Methods

Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu

Abstract

Inocybe is a fungi genus widespread in the world ecosystems and relatively easy to be identified at the genus level; however species identification for this genus is at times may take time due to close similarities in morphological characteristics among some of the species. For this reason, the genus Inocybe has also been continuously evaluated phylogenetically by taking advantage of the developments in molecular approaches in recent years. The phylogenetic analyzes provide useful inputs to tackle taxonomic problems within the genus. In this context, we aim to conduct morphological and molecular analyzes of Inocybe samples collected from Kütahya region to determine phylogenetic positions in the genus. Towards this goal, ITS regions of the samples were sequenced and compared with the other sequences obtained from GenBank. As a result of the morphological and phylogenetic analyzes performed, I. calida, I. cervicolor and I. rimosa taxa were identified from the study area. Furthermore, the Cervicolores, Marginatae and Rimosa sections of these taxa were phylogenetically evaluated and the morphological differences between the species are discussed.

Özet

Dünyada birçok ekosistemde yayılış gösteren Inocybe, cins düzeyinde teşhisi kolay olmasına rağmen, morfolojik özelliklerinin birbirine yakın olmasından dolayı, tür düzeyinde tayini zaman alabilmektedir. Bu nedenle, Inocybe cinsi son yıllardaki moleküler tekniklerdeki gelişmelerin etkisiyle filogenetik olarak değerlendirilmektedir. Yapılan filogenetik analizler, cins içindeki taksonomik problemlerin ortadan kaldırılabilmesi için kullanışlı veriler sunmaktadır. Bu kapsamda, Kütahya yöresinden toplanan Inocybe örneklerinin morfolojik ve moleküler analizi yapılarak cins içindeki filogenetik pozisyonlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Bunun için, örneklerin ITS bölgesinin sekansları çıkartılmış, GenBank’tan alınan diğer sekanslarla karşılaştırılarak analiz edilmiştir. Yapılan morfolojik ve filogenetik analizler sonucunda, araştırma bölgesinden I. calida, I. cervicolor ve I. rimosa taksonları belirlenmiştir. Ayrıca, bu taksonların yer aldığı Cervicolores, Marginatae ve Rimosa seksiyonları filogenetik olarak değerlendirilmiş ve türler arasındaki morfolojik farklılıklar incelenmiştir.