Journals / Mikrobiyoloji Bülteni / 2004 / Cilt: 38 - Sayı: 3
Investigation of Herpes simplex virus DNA by real-time polymerase chain reaction in the clinical samples
- Journal
- Mikrobiyoloji Bülteni
- Pages
- 233–238
- DOI
- —
Abstract
The aim of this study was to investigate the presence of Herpes simplex virus (HSV) type 1 and type 2 DNA from the clinical samples sent to our routine laboratory, by real-time polymerase chain reaction (PCR). A total of 328 samples collected from 306 female and 7 male patients who were admitted to different outpatient clinics were included in the study. The samples included 235 cervical swab samples (of which 150 were from pregnant women), 77 amniotic fluid, 8 blood, 6 cerebrospinal fluid (CSF), one pericardial fluid and one cervical biopsy. DNA extraction were performed with High Pure Viral Nucleic Acid Kit (Roche, Germany) and amplified in Light Cycler (Roche, Germany) with a commercial amplification mix (Metis Biotechnology, Ankara). HSV-DNA positivity were found in 2.1% of the cervical samples (three of 150 pregnant and two of 85 non-pregnant women), two of the blood samples and one of the CSF sample, while there were no positive result for the other clinical specimens. It can be concluded that, realtime PCR would be preferred in conditions requiring rapid diagnosis such as HSV infections of central nervous system and HSV suspected infections of immuno-supressed patients, as a rapid and practical method.
Özet
Bu çalışmada rutin laboratuvarırhıza gelen örneklerde Herpes simpleks virus (HSV) tip 1/2 DNA'sının gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (real-time PCR) ile araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya 306 kadın ve 7 erkek hastadan alınan toplam 328 örnek dahil edilmiştir. Örneklerin 235'i servikal sürüntü (150'si gebe kadın), 77'si amniyon sıvısı, 8'i kan, 6'sı beyin omurilik sıvısı (BOS), biri perikard sıvısı ve biri servikal biyopsidir. Örneklerden High Pure Viral Nucleic Acid Kit (Roche, Almanya) ile DNA'lar elde edilmiş ve ticari bir amplifikasyon karışımı (Metis Biyoteknoloji, Ankara) kullanılarak Light Cycler (Roche, Almanya) cihazında çoğaltılmıştır. Sürüntü örneklerinin %2.1'inde, (gebe kadınların üçü, gebe olmayanların ikisinde), 8 kan örneğinin ikisinde ve 6 BOS örneğinin birinde HSV-DNA pozitifliği saptanmış, diğer örneklerde pozitif sonuç belirlenmemiştir. Sonuç olarak, HSV enfeksiyonlarının tanısında gerçek zamanlı PCR yönteminin hızlı ve uygulanması kolay bir yöntem olarak, özellikle immün yetmezliği ya da merkezi sinir sistemi enfeksiyonu olan hastalar gibi hızlı tanı gerektiren durumlarda tercih edilebileceği kanısına varılmıştır.