Antibiotic resistance in Helicobacter pylori and molecular methods for the detection of resistance

Helicobacter pylori'de antibiyotik direnci ve direncin saptanmasında kullanılan moleküler yöntemler

Abstract

Helicobacter pylori which is the major agent causing peptic ulcer, gastric cancer and gastric lymphoma, is identified as a class I carcinogen. Invasive and non-invasive tests have been used in the diagnosis of H.pylori infection. Clarithromycin resistance in H.pylori strains is increasing nowadays, thus leading to failures in eradication therapy. Fluorescence in situ hybridization (FISH) method which can simultaneously detect the presence of H.pylori and clarithromycin resistance is a non-culture dependent molecular technique. In this review article the prevalence and clinical outcome of antibiotic resistance in H.pylori, molecular mechanisms of the resistance and molecular methods to detect the resistance, with priority of FISH technique have been discussed.

Özet

Helicobacter pylori peptik ülser, gastrik kanser ve gastrik lenfoma etiyolojisinde önemli yeri olan, sınıf I karsinojen olarak tanımlanmış, kronik enfeksiyon etkeni olan bir bakteridir. H.pylori enfeksiyonu tanısında invazif ve invazif olmayan testler kullanılmaktadır. Günümüzde klaritromisine dirençli H.pylori suşları artmakta ve eradikasyon tedavisinin başarısını azaltmaktadır. Kültür dışı tanı yöntemlerinden biri olan floresan in situ hibridizasyon (FISH) metodu, H.pylori varlığını ve klaritromisin direncini eş zamanlı olarak saptayan bir yöntemdir. Bu derleme yazıda, H.pylori 'de antibiyotik direncinin prevalansı ve klinik etkisi, direncin moieküier mekanizmaları ve direnç saptanmasında kullanılan moieküier yöntemler, FISH metodu ön planda tutularak tartışılmıştır.

Keywords: İn situ hibridizasyon, floresan,Mide neoplazmları,Lenfom,Anti-bakteriyel ajanlar,Helicobacter pylori,Helicobacter enfeksiyonları,Klaritromisin,Mide ülseri