Journals / Mikrobiyoloji Bülteni / 2005 / Cilt: 39 - Sayı: 2
Genotyping of Candida albicans starins isolated from nosocomial fungemia patients by pulsed-field gel electrophoresis
- Journal
- Mikrobiyoloji Bülteni
- Pages
- 191–198
- DOI
- —
Abstract
Candida albicans has the most important place among fungal agents causing systemic infections. Molecular epidemiologic methods, especially pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) are used frequently for outbreak investigations and to reveal existing clones in hospital environment. In this study, from 2000 through 2003, 42 C.albicans strains, isolated from the patients with nosocomial fungemia, were genotyped by PFGE. The results revealed that 3}1 different karyotypes existed among the study population. In conclusion, these C.albicans strains which were isolated in our hospital during the study period were not clonally related, whereas they were most probably arising from endogenous sources. It might be emphasized that the combination of PFGE method with a secondary method would be very useful to improve its discriminatory power although PFGE alone gives highly reproducible results.
Özet
Candida albicans sistemik fungal enfeksiyon etkenleri arasında önemli bir yere sahiptir. Salgınların araştırılmasında ve hastane ortamında var olan klonların ortaya konmasında moleküler epidemiyolojik yöntemler ve özellikle "Pulsed-field Gel Electrophoresis" (PFGE) yöntemi sıklıkla kullanılmaktadır. Bu çalışmada, 2000-2003 yıllarını kapsayan dönemde nozokomiyal fungemi etkeni olarak izole edilmiş 42 C.albicans susu PFGE tekniği ile genotiplendirilmiş, 31 farklı karyotip oluşturdukları görülmüştür. Sonuç olarak, hastanemizde söz konusu dönemde izole edilen C.albicans suşlarının klonal yayılım göstermedikleri ve endojen kaynaklı olma olasılıklarının yüksek olduğu saptanmıştır. PFGE tekniğinin oldukça tekrarlanabilir sonuçlar üretmesine karşın, gereken durumlarda ayırım gücünü yükseltmek için ikinci bir yöntemle birlikte kullanılmasının faydalı olacağı vurgulanabilir.