Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2012 / Cilt: 18 - Sayı: 2
Mitochondrial dna d-loop and 12s regions analysis of the long- crowing local breed Denizli fowl from Turkey
- Sayfa
- 191–196
- DOI
- —
Özet
Çalışmanın amacını ülkemiz yerli tavuk ırklarından olan uzun ötüşlü Denizli tavuğunun mitokondriyal DNA 12S ve D-loop bölgelerinin gen dizi analizine göre genetik yapısının ortaya çıkarılması oluşturmaktadır. Bu amaçla DNA izolasyonu için Denizli horozlarından alınan tüy örnekleri kullanılmıştır. D-loop ve 12S bölgeleri polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile amplifiye edilmiş ve sırasıyla 1230 bç ve 950 bç uzunluğunda PZR ürünleri elde edilmiştir. D-loop ve 12S bölgelerinin gen dizi analizleri çıkarılmış ve daha önce yayınlanmış ilgili gen bölgeleriyle analize tabi tutulmuştur. 12S bölgesinin gen dizisi incelendiğinde %32A, %19T, %19G ve %30C olarak bulunmuştur. D-loop bölgesi için AT ve GC oranları ise sırasıyla %59.88 ve %40.12 olarak gözlemlenmiştir. D-loop bölgesi gen dizi analizi sonuçları Denizli ırkının „uzun ötüşlü ırklar arasında yer aldığını açık olarak ortaya koymuştur. Sonuçlar bu lokal ırkın mitokondriyal DNA’sı hakkında ilk informatif verileri ortaya koymuştur.
Abstract
Aim of this study is to analyze the genetic structure of long-crowing Denizli chicken, a Turkish local fowl, using nucleotide sequences of the mitochondrial DNA 12S and D-loop regions. DNA isolation was carried out using feather samples of cocks of this local breed. D-loop and 12S regions were amplified using polymerase chain reaction technique and ca 1230 bp and 950 pb PCR products were obtained respectively. Native genotype Denizli fowl’s D-loop and 12S regions were sequenced and sequencing data were analyzed and compared with the related published data. Nucleotide content of the 12S region showed a 32% A, 19% T, 19% G and 30% C, whilst AT and GC ratios were found as 59.88% and 40.12% respectively for D-loop region. D-loop sequence data analysis clearly identified the Denizli fowl within the clade of long-crowing cocks. The results give the first informative data about the mitochondrial DNA D-loop and 12S regions of this local breed from Turkey.