Journals / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2013 / Cilt: 19 - Sayı: 2
Translation of nucleotide sequences to amino acids and their comparison with data stored in databases
- Pages
- 359–363
- DOI
- —
Abstract
The advances in the field of molecular biology and DNA sequencing have been leading to obtain a large amount of new data and information. The rapid and precise evaluation of these data has made it imperative to use a new interdisciplinary science called Bioinformatics. Of microorganisms, viruses, whole or partial sequence analysis of the target gene can be used for genotyping and phylogenetic analysis studies. The viral DNA sequences encoding viral protein can be translated to amino acid sequences. In this way, whether or not certain mutation(s) on nucleotide sequences result in amino acid substitutions can be investigated. In addition, the obtained nucleic and amino acid sequence data can be compared with those stored in the databases by means of similarity researches. Thus, it is very important to store sequence results to databases.
Özet
Moleküler biyoloji ve DNA sekans analizi çalışmalardaki gelişmeler sonucu elde edilen yeni bilgi ve verilerin hızlı ve hassas bir şekilde değerlendirilmesi ihtiyacı Biyoinformatik adlı bir bilimin kullanılmasını gerekli kılmıştır. Mikroorganizmalardan virüslere ait hedef alınan gen bölgesinin tüm veya kısmi sekans analizleri yardımıyla filogenetik analizler ve genotiplendirme çalışmaları yapılabilmektedir. Viral proteinleri kodlayan gen sekansları protein dizilerine çevrilebilmektedir. Bu sayede belli pozisyonlardaki nükleotid farklılıklarının aminoasit farklılığına da sebep olup olmadığı gibi durumlar değerlendirilebilmektedir. Nükleotid ve aminoasit sekans sonuçları veri tabanlarındaki diğer verilerle mukayese edilip, benzerlik ile ilgili değerlendirmeler yapılabilmektedir. Elde edilen nükleotid ve aminoasit sekans verilerinin veri tabanlarına girilmesi bilgilerin diğer araştırmacılar tarafından kullanılması açısından çok önemlidir.