Journals / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2013 / Cilt: 19 - Sayı: 2
Gökkuşağı alabalıklarından izole edilen Yersinia ruckeri suşlarının fenotipik, serotipik ve genetik farklılıklarının belirlenmesi ve antibioyotiplendirilmesi
- Pages
- 225–232
- DOI
- —
Abstract
In this study, 15 Yersinia ruckeri isolates that had been isolated from rainbow trout farms and 2 reference strains (serotype 1 and serotype 2) were examined in terms of phenotypic, serotypic and genotypic characteristics. Conventional microbiological and API 20 E tests were used to determine phenotypic characteristics of Y. ruckeri isolates and it was determined that the Y. ruckeri showed significantly homogenous profile by microagglutination test performed by using serotype 1 and serotype 2 immunsera, and 11 of 15 isolates were serotyped as serogroup 1 while the rest 4 were serotyped as serogroup 2. In Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis, Y. ruckeri isolates were genotyped within 2 separate clusters according to 70% similarity coefficient index and it was detected that first cluster includes 2 genotypes (YR1 and YR2) and second cluster includes 3 genotypes (YR3, YR4 and YR5). Furthermore, antibiotic resistance profiles of Y. ruckeri strains were determined and it was found that they were resistance to florfenicol, erythromycin, oxytetracycline and trimethoprim-sulphamethoxazole which have been licensed for fish health in Turkey. It is considered that findings obtained will form a basis to develop diagnosis kit and/or vaccination for Y. ruckeri.
Özet
Bu çalışmada gökkuşağı alabalığı işletmelerinden izole edilmiş olan 15 adet Yersinia ruckeri izolatının 2 adet referans suşla (serotip 1 ve serotip 2) karşılaştırmalı olarak fenotipik, serotipik ve genotipik özellikleri bakımından incelenmesi amaçlanmıştır. Y. ruckeri izolatlarının fenotipik özelliklerinin belirlenmesinde klasik mikrobiyolojik ve API 20 E testleri kullanılmış ve bu testlerde bakterinin oldukça homojen bir yapı gösterdiği belirlenmiştir. Serotip 1 ve serotip 2 immunserumlar kullanılarak yapılan mikroaglütinasyon testinde ülkemizden izole edilmiş olan 15 suştan 11’nin serotip 1, 4’ünün ise serotip 2 özellikte olduğu belirlenmiştir. Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) analizinde Y. ruckeri izolatları %70 benzerlik katsayısına göre 2 ayrı küme içerisinde gruplanmış, kümelerden birincisinin 2 (YR1 ve YR2), ikincisinin ise 3 genotip (YR3, YR4 ve YR5) içerdiği saptanmıştır. Ayrıca bu çalışmada Y. ruckeri izolatlarının antibiyotik duyarlılıkları belirlemiş ve bu izolatların ülkemizde balıklarda ruhsatlı olan florfenikol, eritromisin, oksitetrasiklin ve trimetoprim-sulfamethoxazole karşı direnç geliştirmiş oldukları saptanmıştır. Çalışma sonucunda elde edilen bulguların Y. ruckeri için teşhis kiti ve/veya aşı geliştirme çalışmalarına temel teşkil edeceği düşünülmektedir.