Journals / Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2011 / Cilt: 1 - Sayı: 4

Evaluation of Root Associated Bacteria for Control of Cotton Root Rot Caused by Fusarium oxysporum in Salinated Soils

Tuzlu Topraklarda Fusarium Oxysporum’un Neden Olduğu Pamuk Kök Çürüklüğüne Karşı Kök İlişkili Bakterilerin Etkisinin Değerlendirilmesi

Pages
37–42
DOI
—

Abstract

High salinity of soils in arid and semi arid regions results in desertification and decreased crop yield.In such conditions plants become more vulnerable to diseases caused by pathogenic fungi. The aim of the presentwork was to select enhanced root colonizing bacteria for their ability to promote plant growth and control root rotof cotton caused by Fusarium oxysporum in salinated soil. The best five enhanced cotton root tip colonizer bacteriawere selected from the rhizosphere of cotton grown in saline soil and were identified by the 16S rRNA gene sequenceas Pseudomonas spp., Pseudomonas putida, P. chlororaphis, Pseudomonas mendocina and Pantoea agglomerans.They showed ability to promote plant growth and to control root rot of cotton caused by F. oxysporum. Infestationof the soil with F. oxysporum resulted in an increase of diseased plants up to 60%. Selected bacterial strains,reduced this proportion to as low as 19 % and also stimulated cotton growth. These results are promising forthe application of selected environmentally safe biological control agents in protecting cotton against root rot diseasein saline agricultural soils.

Özet

Kurak ve yarı kurak bölgelerde bulunan yüksek oranda tuz içeriğine sahip topraklar çoraklaşmaya yol açmakta ve böylece ürün veriminin azalmasına neden olmaktadır. Bu şartlar altında bitkiler patojenik mantarların neden olduğu hastalıklara karşı daha duyarlıdırlar. Bu araştırmanın amacı, bitkinin gelişme yeteneğini artıran kök koloni bakterisini seçmek ve tuzlu topraklardaki Fusarium oxysporum’un sebep olduğu pamuk kök çürüklüğü hastalığını kontrol altına almaktır. Araştırmada, gelişmiş pamuk kök kolonizer bakterisi tuzlu topraklarda büyüyen pamuk bitkisinin rizosferinden seçilmiş ve Pseudomonas spp., Pseudomonas putida, P. chlororaphis, Pseudomonas mendocina and Pantoea agglomerans gibi 16rRNA geni ile tanımlanmıştır. Araştırmada bitki büyüme süreci iyileştirilmiş ve F. Oxysporum ‘un sebep olduğu pamuk kök çürüklüğü kontrol altına alınmıştır. F. Oxysporum’un bulaşmış olduğu topraklarda hastalık oranı % 60 oranında artmıştır. Seçilen bakteri suşları bu oranı % 19 oranında azaltmış ve aynı zamanda pamuğun gelişmesini artırmıştır. Bu sonuçlar tuzlu tarım topraklarında yetiştirilen pamuk bitkisinde görülen kök çürüklüğü hastalığına karşı biyolojik kontrol etmenlerinin uygulanmasının yararlı olacağını göstermektedir

Keywords: Biyolojik kontrol, pamuk kök çürüklüğü, Fusarium oxysporum, bitki gelişimi