L-Piroglutamik Asit Molekülünün TD-DFT ve NBO Analizleri

Özet

Öz Bu çalışmada, L-piroglutamik asit (L-PGA) molekülünün konformasyonları yoğunluk fonksiyon teorisi (DFT) B3LYP/6-311++G(d,p) seti yaklaşımı ile optimize edilmiş ve potansiyel enerji dağılımı ile bariyer enerjileri hesaplanmıştır. L-PGA, minimum enerjiye sahip dört konformasyona sahip olup, I. Konformasyon en kararlı yapıdadır. Molekülün II, III ve IV. konformasyonlarının bağıl elektronik enerjileri farkı, sırasıyla 3,5, 12,6 ve 25,6 kJ mol−1 değerindedir. Konformasyonlardan en düşük enerjiye sahip molekül cis formunda, diğer ikisi trans formunda karboksilik asit grubuna sahiptir. Fock matris denklemleri ile donör akseptör etkileşimleri, doğal bağ orbital (NBO) analizi ile Gaussian programına entegre NBO 3.1 programı ile incelenmiştir. Zamana-bağlı yoğunluk fonksiyon teorisi (TD-DFT) hesaplarında, L-PGA molekülünün dalga fonksiyonu Schrödinger kuantum mekanik denklemleri ile çözülerek, uyarılma durum enerjileri hesaplanmıştır.