Journals / Gülhane Tıp Dergisi / 2003 / Cilt: 45 - Sayı: 2
Genetic analysis of Escherichia coli strains isolated from patients with spinal cord injury by random amplified polymorphic DNA-PCR (RAPD) method
- Journal
- Gülhane Tıp Dergisi
- Pages
- 143–146
- DOI
- —
Abstract
Genetic Analysis of Escherichia coli Strains Isolated From Patients With Spinal Cord Injury by Random Amplified Polymorphic DNA-PCR (RAPD) Method It was aimed to find out the genetic relationship in between multipl antibiotic resistant Escherichia.coli strains isolated as nosocomial agents from uriners of patients with spinal cord injury by Random Amplified Polymorphic DNA-PCR (RAPD) and the practicability of this method. The strains identified by convantional methods were performed antimicrobial susceptibility testing for 17 kinds of antibiotic. 32 of 61 (52.4 %) strains were resistant to more than one antibiotic. Those of 32 strains were genotyped by RAPD method. Dendrogram of the strains has been performed on SPSS 10.0 program by using the band patterns and genetic relationship of them was determined. While having six strains in the most extensive group and three groups with only one strains, E.coli strain were described in 12 groups. As regard to genetic differences it was concluded that E.coli strains were not originated from sole source and RAPD was an easy and rapid method for epidemiological researches.
Özet
Spinal kord yaralanması (SKY) nedeniyle yatan hastaların idrarlarından hastane infeksiyonu etkeni olarak izole edilen çoklu antibiyotik dirençli Escherichia coli suşlarının Random Amplifiye Polimorfik DNA-PCR (RAPD) yöntemi ile birbirlerine olan genetik yakınlıkları ve yöntemin uygulanabilirliğinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. Klasik yöntemlerle tanımlanmış olan suşlara 17 antibiyotik için duyarlık testi yapılmıştır. Çalışmaya alınan 61 suşun 32 (%52.4)'sinin birden fazla antibiyotiğe dirençli olduğu tespit edilmiştir. Bu 32 suş RAPD yöntemi ile genotiplendirilmiştir. Elde edilen bant paternleri ile suşların SPSS 10.0 programında dendrogramları çıkarılmış ve birbirlerine olan genetik yakınlıkları tespit edilmiştir. Buna göre E.coli suşları 12 gruba ayrılırken en geniş grupta altı ve üç grupta da birer sus yer almıştır. Sonuç olarak, E.coli suşlarının genetik olarak birbirlerinden farklı oldukları ve tek kaynaktan köken almadıkları görülmüş, RAPD-PCR yönteminin epidemiyolojik araştırılmalarda uygulanması kolay ve hızlı bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır.