Journals / ANKEM Dergisi / 2008 / Cilt: 22 - Sayı: 1
Extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella strains isolated from urine samples of pediatric outpatients in a two-months period
- Journal
- ANKEM Dergisi
- Pages
- 14–19
- DOI
- —
Abstract
In this study extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli (n=11) and Klebsiella (n=4) strains isolated from urine samples of child outpatients in a two-months period in Istanbul Medical Faculty Pediatric Nefrology Department were examined. All strains showed extended-spectrum beta-lactamase phenotype with E-test ESBL and were susceptible to carbapenems. According to polimerase chain reaction (PCR) results, nine of the E.coli strains (82 %) were found to produce TEM-type, two strains (18 %) CTX-M-type beta-lactamases. K.pneumoniae strains (n=2) were found to produce both TEM-type and SHV-type beta-lactamases. Only one of the K.oxytoca strains (n=2) was found to produce TEM-type beta-lactamase. It was thought that the second K.oxytoca strain had beta-lactamase other than TEM, SHV; CTX-M beta-lactamases. The profiles generated with RAPD-PCR using ERIC-2 primer contained several bands, ranging in size from 170 to 1500 bp. According to RAPD-PCR assays, it was found that two K.pneu-moniae and two K.oxytoca strains had same profile. In conjugation experiments, 10 of 15 strains (67 %) transferred their resistance to recipient E.coli strain. Plasmid profile analysis showed that all strains had more than one plasmid. It was found that the sizes of plasmids were bigger than 48 kb. Although the isolation of many ESBL producing strains in a short period and the similarity of the strains’ enzyms according to the RAPD-PCR and plasmid analysis results suggested that there may be a relationship between the strains, a definite relation between the patients was not found. However the clinical diagnosis of many of the patients was disfunc-tion of bladder. So the disfunction of bladder could be thought as a risk factor for colonization with ESBL-producing bacteria.
Özet
Bu çalışmada, iki aylık bir sürede İstanbul Tıp Fakültesi Pediatrik Nefroloji Bilim Dalı’nda ayaktan takip edilen çocuk hastaların idrar örneklerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) oluşturan Esherichia coli (n=11) ve Klebsiella spp. (n=4) suşları incelenmiştir. Tüm suşlar karbapenemlere duyarlı bulunmuş ve “E-test ESBL” ile GSBL fenotipi gösterilmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) sonuçlarına göre, E.coli suşlarının dokuzunun (% 82) TEM-tipi, ikisinin (% 18) CTX-M-tipi beta-laktamaz ürettiği bulunmuştur. K.pneumoniae suşlarının (n=2) hem TEM, hem de SHV-tipi beta-laktamaz ürettiği, K.oxytoca suşlarından (n=2) ise sadece birinin TEM tipi beta-laktamaz ürettiği saptanmış, ikinci K.oxytoca suşunun TEM, SHV, CTX-M’den başka bir beta-laktamaz taşıdığı anlaşılmıştır. ERIC-2 primeri kullanılarak yapılan RAPD-PCR ile suşların, büyüklükleri 170-1500 bp arasında değişen çeşitli bantlar içerdiği bulunmuştur. RAPD-PCR deneylerine göre iki K.pneumoniae ve iki K.oxytoca suşunun birbiriyle aynı profile sahip olduğu bulunmuştur. Konjugasyon deneylerinde 15 suşun 10’u (% 67) dirençlerini alıcı E.coli suşuna aktarmıştır. Plazmid profil analizi, tüm suşların birden fazla plazmide sahip olduğunu göstermiştir. Suşlardaki plazmidlerin 48 kb’dan büyük olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak, kısa bir sürede poliklinik hastalarından çok sayıda GSBL pozitif suşun izole edilmesi, RAPD-PCR ve plazmid analizi sonuçlarına göre suşların büyük bir kısmının taşıdığı enzimler bakımından benzerlik göstermesi, izole edilen suşların ilişkili olduklarını düşündürmekle birlikte, suşların izole edildiği hastalar arasında bir ilişkiye rastlanmamıştır. Ancak hastalarda mesane disfonksiyonu tanısının çokluğu, mesane disfonksiyonunun GSBL oluşturan bakterilerle kolonizasyon için bir risk faktörü olabileceğini düşündürmüştür.