Phylogeny of Some Melanoleuca Species (Fungi: Basidiomycota) in Turkey and Identification of Melanoleuca angelesiana A.H. Sm. As a First Record

Türkiye’deki Bazı Melanoleuca türlerinin (Fungi: Basidiomycota) Filogenisi ve Yeni bir Kayıt Olarak Melanoleuca angelesiana A.H. Sm. Türünün Tanımlanması

Abstract

Aim of Study: The purposes of the present study are to describe and identify all collected Melanoleuca samples using morphological characters, determine phylogenetic relationships among species using DNA sequences of ITS and LSU regions and check the number of subgenera of Melanoleuca genus. Area of Study: Samples were collected from different parts of Turkey and the study was conducted at the Department of Molecular Biology and Genetics in Van Yüzüncü Yıl University. Material and Methods: Twenty-two samples, representatives of fourteen species, were used. Structures of pileus, stipe, lamellae and basidia, cystidia, spores were used as macroscopic and microscopic features, respectively. The nuclear ribosomal internal transcribed spacer region (nrITS) and largest subunit (LSU) were amplified for molecular analyses. Main results: Taxonomic positions of some Melanoleuca species from Turkey were evaluated based on both morphological characters and sequences of two different nuclear DNA regions. nrITS region was more informative (112 variable sites in ITS1, 1 in 5.8S and 95 in ITS2 subregions) compared to LSU (46 variable sites). Analyses of ITS region revealed that the genus Melanoleuca was monophyletic and divided into two subgenera as Melanoleuca and Urticocystis. Research highlights: Within studied species, Melanoleuca angelesiana was firstly reported for mycobiota of Turkey

Özet

Çalışmanın Amacı: Bu çalışmanın amacı toplanan Melanoleuca örneklerinin morfolojik karakterlerle tanımlanması, ITS ve LSU DNA sekanslarını kullanarak türlerin filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi ve Melanoleuca cinsinin alt cins sayısının teyit edilmesidir. Çalışma Alanı: Örnekler Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanmış ve çalışma Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü'nde gerçekleştirilmiştir. Material ve Yöntemler: On dört türü temsil eden yirmi iki örnek kullanılmışır. Şapka, sap, lamel yapıları ve bazidya, sistidya, spor yapıları sırasıyla makroskopik ve mikroskopik özellikler olarak kullanılmıştır. Nükleer ribozomal iç aralayıcı bölge (nrITS) ve ribosomal en büyük alt birim (LSU) moleküler analizler için amplifiye edilmiştir. Ana sonuçlar: Bu çalışmada, Türkiye'den bazı Melanoleuca türlerinin taksonomik konumları hem morfolojik karakterleri hemde iki farklı nükleer DNA bölgesinin sekansları ile değerlendirilmiştir. nrITS bölgesi (ITS1’de 112, 5,8S’de 1, ve ITS2’de 95), LSU bölgesine (46 değişken alan) kıyasla daha bilgilendirici olmuştur. ITS bölgesinin analizleri Melanoluca cinsinin monofletik olduğunu ve Melanoleuca ve Urticocystis olarak iki alt cinse ayrıldığını göstermiştir. Araştırma konuları: İncelenen türler içerisinde Melanoleuca angelesiana Türkiye mikobiyotası için ilk defa rapor edilmiştir.