Journals / Acta Aquatica Turcica / 2019 / Cilt: 15 - Sayı: 2

Phylogenetic Analysis of Jellyfish Species of Aurelia aurita Distributed in the Sea of Marmara

Marmara Denizi’nde Yayılış Gösteren Aurelia aurita Denizanası Türünün Filogenetik Analizi

Pages
163–170
DOI
—

Abstract

In our study, the species Aurelia aurita jellyfish belonging to the Cnidaria branch distributed in the coasts of the Marmara Sea were examined phylogenetically. For this purpose, DNAs were isolated from the jellyfish samples collected from the northern and southern coasts of the Marmara Sea between October 2017 and February 2018, and mitochondrial Cytochrome Oxidase Subunit I (COI), 16S rDNA, nuclear 18S rDNA and Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gene regions were amplified by PCR and sequence analysis was performed. Phylogenetic analysis was carried out with the evaluation of the obtained results together with the sequences obtained from GenBank and inter-species relationships were determined.

Özet

Çalışmamızda Marmara Denizi sahillerinde yayılış gösteren Knidliler şubesine ait Aurelia aurita denizanası türü filogenetik olarak incelenmiştir. Bunun için Ekim 2017- Şubat 2018 tarihleri arasında Marmara Denizi’nin kuzey ve güney sahillerinden toplanan denizanası örneklerinden DNA’lar izole edilmiş ve mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI), 16S rDNA, nüklear 18S rDNA ve Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gen bölgeleri Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ile amplifiye edilmiş ve ardından dizi analizleri yapılmıştır. Filogenetik analizler GenBank’tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirilmiş ve türler arası ilişkiler belirlenmiştir.

Keywords: Aurelia aurita, COI, 16S rDNA, 18S rDNA, ITS1, filogenetik analiz