Evaluation of Candida Strains Isolated from Clinical Specimens

TUBA MÜDERRİS,SÜREYYA GÜL YURTSEVER,Rahim ÖZDEMİR,AYŞEGÜL AKSOY GÖKMEN,Nükhet KURULTAY,Nurten BARAN,SELÇUK KAYA

Abstract

Introduction: The increased use of antibiotics and antifungals for prophylactic and therapeutic purposes in hospitals cause an increase in fungal infections. In recent years, the increase and resistance development in infections caused by non-albicans Candida (NAC) have increased the importance of identification of fungi at the species level. The aim of this study was to identify Candida species isolated from various clinical specimens. Materials and Methods: Candida species isolated from sterile clinical samples in our laboratories between 2014-2017 were evaluated retrospectively. Blood samples were incubated in BACTEC FX (BD, USA) automated system for five days and other samples were incubated at 37°C for 18-24 hours after cultured in 5% sheep blood, chocolate, Eozin Methylene Blue and Saboraud dekstroz agars. The species differentiation of the strains that was identified as yeast with Gram staining was done by both conventional methods and automated system (PhoenixTM 100-yeast ID, BD, USA). Results: In this study, a total of 996 Candida growth was detected; including 43.2% Candida albicans and 56.8% NAC. The most frequently isolated NAC species were; C. parapsilosis (27.6%), C. tropicalis (17.9%), C. glabrata (4.3%) and C. kefyr (2.5%). Candida species were isolated mostly from urine (50.7%), blood (44.3%), catheter (2.6%) and peritoneal fluid (0.8%). The most frequently isolated species in blood were C. parapsilosis (52.8%), C. albicans (29.5%), C. tropicalis (11.1%) and C. glabrata (3.4%). In samples from intensive care units (ICU), the most common species were C. albicans (40.5%) and C. parapsilosis (35.9%). It was found that the rate of C. albicans decreased in the last two years while the rates of C. parapsilosis increased significantly in 2017 among the samples that came from the ICU. In addition, when all the clinics were evaluated, C. parapsilosis rate increased significantly in 2017 when compared to other years. Conclusion: Non-albicans Candida types are the most commonly isolated Candida species in our hospital. In our study, the most common isolated NAC was C. parapsilosis in the blood samples while its rate was significantly high in the samples from the ICU. We think that due to intrinsic resistance, hospitals should determine their epidemiologic data periodically for prevention, development of treatment strategies, planning of clinical treament policies, monitoring of the infection course and evaluation of the infection control measures.

Özet

Giriş: Hastanelerde profilaktik ve tedavi amacıyla antibiyotik ve antifungallerin kullanımının giderek artması mantar infeksiyonlarının günümüzde daha sık görülmesine neden olmuştur. Son yıllarda albicans dışı kandida (ADK) türleri ile oluşan infeksiyonlardaki artış ve direnç gelişimi, tür düzeyinde tanımlamanın önemini arttırmıştır. Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen kandida türlerinin tanımlanması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Çalışmamızda 2014-2017 yılları arasında laboratuvarımıza gelen tüm steril örneklerden izole edilen kandida türleri retrospektif olarak değerlendirildi. Kan örnekleri BACTEC FX (BD, USA) otomatize sisteminde beş gün, diğer örnekler ise %5 koyun kanlı agar, çikolata agar, Eozin Metilen Blue agar ve Saboraud dekstroz agar besiyerlerine ekildikten sonra 37°C’de 18-24 saat inkübe edildi. Gram boyama ile maya mantarı olarak belirlenen suşların tür ayrımı, konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistem (PhoenixTM 100-yeast ID, BD, USA) kullanılarak yapıldı. Bulgular: Bu çalışmada %43.2’sinde Candida albicans, %56.8’inde ADK olmak üzere toplam 996 kandida üremesi saptanmıştır. En sık izole edilen ADK türleri; Candida parapsilosis (%27.6), Candida tropicalis (%17.9), Candida glabrata (%4.3) ve Candida kefyr (%2.5) olarak belirlenmiştir. Kandida türleri çoğunlukla idrar (%50.7), kan (%44.3), kateter (%2.6) ve periton sıvısı (%0.8) örneklerinden izole edilmiştir. Kan örneklerinden en sık C. parapsilosis (%52.8), C. albicans (%29.5), C. tropicalis (%11.1) ve C. glabrata (%3.4) izole edilmiştir. Yoğun bakım ünitesi (YBÜ)'nden gelen örneklerde en çok C. albicans (%40.5) ve C. parapsilosis (%35.9) saptanmıştır. Son iki yılda YBÜ’de C. albicans oranının düştüğü, 2017 yılında ise C. parapsilosis oranının belirgin olarak arttığı saptanmıştır. Ayrıca tüm klinikler değerlendirildiğinde 2017 yılında diğer yıllara göre C. parapsilosis oranının belirgin olarak arttığı saptanmıştır. Sonuç: Hastanemizde ADK türleri en sık izole edilen kandida türleridir. Çalışmamızda kan örneklerinde en sık, YBÜ’de ise yüksek oranda C. parapsilosis izolasyonu saptanmıştır. İntrensek direnç nedeniyle hastanelerin kendi epidemiyolojik verilerini belirli aralıklarla tespit etmesi, korunma, tedavi stratejilerinin geliştirilmesi, klinik tedavinin yönlendirilmesi, infeksiyon seyrinin izlenmesi ve infeksiyon kontrol önlemlerinin değerlendirilmesi bakımından yararlı olacaktır.