Journals / Alatarım / 2009 / Cilt: 8 - Sayı: 1
Molecular detection of seed-borne viruses in Kahramanmaras red peppers
- Journal
- Alatarım
- Pages
- 1–7
- DOI
- —
Abstract
Six seed-borne viruses (AMV, CMV, TMV, ToMV, TSWV, PMMoV) in chilli pepper grown in Kahramanmaras were identified by RT-PCR. Study materials were chilli pepper seeds from the pepper drying factories in different locations (Kilili, Narli, Beyoglu, Pazarcik, Sekeroba…etc.) and Department of Horticulture at Agricultural Faculty of Kahramanmaras Sutcuimam University, in which researchers have particular studies on them, in cultivation period of 2006-2007. A total of 125 seed samples were sown and young seedlings were processed for total nucleic acid extraction. RTPCR analysis was used to identify those six viruses. Analysis demonstrated that there was no virus infection in seed samples, except CMV virus infection. Out of all tested samples, cDNA from one sample gave CMV-specific DNA band at 513 bp in size. It is possible to express seed transmission of pepper viruses has not been efficient way to transmit the viruses in the area.
Özet
Kahramanmaraş’ta yetiştirilen biberlerde, tohumla taşınan altı virüsün (AMV, CMV, TMV, ToMV, TSWV, PMMoV) RT-PCR yöntemiyle tanıları yapılmıştır. Çalışma materyali olarak 2006-2007 yıllarında Kahramanmaraş’ta faaliyet gösteren biber kurutma fabrikalarına farklı lokasyonlardaki (Kılılı, Narlı, Beyoğlu, Pazarcık, Şekeroba…vs) üreticilerden gelen biberler ile Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi (KSÜ), Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü öğretim elemanlarının daha önceki yıllarda yürüttükleri çalışmalarında kullanmak üzere yöreden toplamış oldukları biberlerden elde etmiş oldukları tohumlar kullanılmıştır. Toplam 125 farklı üründen alınan tohumlar çimlendirilmiş ve biber fidelerinden toplam nükleik asit izolasyonu yapılmıştır. Belirtilen virüslerin tanıları için RT-PCR analizleri ile uygulanmıştır. Analizler sonunda biber tohumlarında CMV haricinde hiçbir virüsün enfeksiyonu tespit edilmemiştir. Bütün örnekler içerisinde bir biber örneğinden alınan cDNA’da CMV enfeksiyonunu gösteren 513 bç büyüklüğünde band gözlenmiştir. Buna göre Kahramanmaraş’ta yetiştirilen biberlerde, tohumla taşınmanın viral ajanlarının yayılmasında önemli bir etken olmadığı görüşünü belirtmek mümkündür.