Journals / Mediterranean Agricultural Sciences / 2019 / Cilt: 32 - Sayı: 1
Molecular screening for TSWV resistance in F2 pepper (Capsicum annuum L.) genotypes from different genetic background
- Pages
- 43–48
- DOI
- —
Abstract
A CAPS marker linked to resistance gene to TSWV in pepper was employed to classify tolerant and susceptible plants at co-dominant level (RR, Rr, rr). During this process selecting heterozygote and homozygote resistant plants from different genetic backgrounds may show some deviations. In this experiment for determination of heterozygote/homozygote resistance/susceptible genotypes developed from different genetic background using two enzymes (XbaI and TaqI) separately at the same time and assessing the gel pictures together was studied. For this purpose, the F2 pepper plants belonging to two different population and each population developed from different genetic background were tested with SCAC568 marker. The genomic DNA of 110 plants representing both populations were amplified with SCAC568 CAPS marker and the PCR products were digested with XbaI and TaqI enzymes. The digested fragments were separated in agarose gel and visualized under UV light. The genotypes belonging to one population gave the expected segregation (1RR: 2Rr: 1rr) at F2 level while the other population required digestion of PCR products with both XbaI and TaqI enzyme separately and assessment the results together to determine resistant and susceptible plants at co-dominant level and to obtain the expected F2 segregation. The results showed that SCAC568 CAPS marker can be used successfully to select the resistant and susceptible genotypes in F2 segregation population by employing two enzymes.
Özet
TSWV’ye dayanıklılık geni ile ilişkili olan SCAC568 CAPS markırı ıslah programlarında dayanıklı ve hassas biber genotiplerini ko-dominant seviyede (RR, Rr, rr) ayırt etmek için kullanılmaktadır. Ancak farklı genetik arka plana sahip olan bazı ıslah materyallerinin heterozigot ve homozigot düzeyde seleksiyonunda tutarsız sonuçlar alınabilmektedir. Bu çalışmada farklı genetik kaynaklardan elde edilmiş F2 biber genotiplerinin SCAC568 markırı kullanarak domates lekeli solgunluk virüsü (TSWV)’ne karşı dayanıklılığının moleküler yöntemlerle testlenmesinde iki farklı enzimle (XbaI ve TaqI) yapılan kesim sonuçlarının karşılaştırmalı olarak birlikte değerlendirilmesinin ve dayanıklı ile hassas genotiplerin ko-dominant seviyede belirlenmesinde kullanılabilirliğinin test edilmesi amaçlanmıştır. Çalışmada F2 aşamasındaki iki popülasyona ait genotipler SCAC568 CAPS markırı kullanılarak test edilmiştir. Çalışmada her iki popülasyondan toplam 110 adet F2 bitkisine ait genomik DNA SCAC568 CAPS markırı ile PCR’da çoğaltılmış ve elde edilen PCR ürünleri XbaI ya da TaqI enzimleri ile kesilmiştir. Kesim ürünleri % 2’lik agaroz jelde ayrıştırılarak UV altında görüntülenmiştir. Çalışma sonuçları popülasyonlardan bir tanesine ait F2 genotiplerinde heterozigot ve homozigot düzeyde beklenen genotipik açılımı (1RR:2Rr:1rr) verirken diğer popülasyonda F2 seviyesinde beklenen açılımın elde edilebilmesi için her iki enzime ait kesim sonuçlarının birlikte değerlendirilmesi sonucu dayanıklı ve hassas bireylerin heterozigot ve homozigot seviyede ayırt edilebileceğini göstermiştir. Sonuçlar açılım gösteren F2 popülasyonlarında SCAC568 CAPS markırının TSWV’ye karşı hassas ve dayanıklı genotiplerin belirlenmesinde, iki enzimle kesim yapılarak başarılı bir şekilde kullanılabileceğini teyit etmiştir.